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珊瑚海super

木虫 (著名写手)

[求助] 如何对齐DNA序列? .fasta 文件里包含15000条序列 已有1人参与

有没有什么神软件能同时对齐这么多序列?多谢大神们。
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zyz2007

金虫 (正式写手)

序列多样性怎么样?,如果有完全一样的序列,可以用cdhit去冗余

发自小木虫IOS客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2020-04-01 17:25:08
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查看全部 4 个回答

liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
小冀-: 金币+2, 鼓励回帖交流 2020-04-02 10:59:14
珊瑚海super: 金币+200, ★★★★★最佳答案, 感谢,搜了一下这个软件,简单学了学,直线了我的目的。 2020-04-02 21:34:03
每条序列多长呢?如果不是太长,可以试试mafft
2楼2020-04-01 08:37:51
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珊瑚海super

木虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by zyz2007 at 2020-04-01 17:25:08
序列多样性怎么样?,如果有完全一样的序列,可以用cdhit去冗余

感谢回复
4楼2020-04-02 21:34:24
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