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Lyria_vet

新虫 (初入文坛)

[求助] GenBank上传序列 已有1人参与

求助

    各位老师,我在GenBank上传了约50条ITS序列,其中有三条怎么都上传不了,提示:

Problematic sequences were found in your submission. Problematic sequences may be misassembled, chimeric, or the RNA/ITS features cannot be clearly identified.
Affected Sequences: Report.
See the form below and select an option.

    这50条序列相似度非常高,只分别由几个碱基不同,所有的序列格式均相同,除了这三条其余的序列均成功上传。我已将尝试重新输入,甚至BLAST比对出最相似的下载下来再把不一样的几个碱基手动修改。我BLAST结果显示和已发表序列Query cover100%,percent identity 98~99%,但还是我无法上传。

    求助各位老师,有没有遇到过同样的情况呢?怎么解决呢?
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me_creazy

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你可以检查下你这3条序列中是否含有非ATGC之外的其他的字母或者字符
2楼2020-03-28 21:17:24
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

ITS应该有特征序列,未通过数据库鉴定
3楼2020-04-08 12:03:51
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