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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » GenBank上传序列
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Lyria_vet

新虫 (初入文坛)

[求助] GenBank上传序列 已有1人参与

求助

    各位老师，我在GenBank上传了约50条ITS序列，其中有三条怎么都上传不了，提示：

Problematic sequences were found in your submission. Problematic sequences may be misassembled, chimeric, or the RNA/ITS features cannot be clearly identified.
Affected Sequences: Report.
See the form below and select an option.

    这50条序列相似度非常高，只分别由几个碱基不同，所有的序列格式均相同，除了这三条其余的序列均成功上传。我已将尝试重新输入，甚至BLAST比对出最相似的下载下来再把不一样的几个碱基手动修改。我BLAST结果显示和已发表序列Query cover100%，percent identity 98~99%，但还是我无法上传。

    求助各位老师，有没有遇到过同样的情况呢？怎么解决呢?
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1楼 2020-03-28 12:25:10
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me_creazy

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你可以检查下你这3条序列中是否含有非ATGC之外的其他的字母或者字符
赞一下 回复此楼
2楼2020-03-28 21:17:24
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)
ITS应该有特征序列，未通过数据库鉴定
赞一下 回复此楼
3楼2020-04-08 12:03:51
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