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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】discover出错问题
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shaopeng6539

[交流] 【求助】discover出错问题

我只是参照别人做的东西换了一个力场，用discover模块先setup就出现这样的提示
Warning:Energy:The simulation box is not neutral.但是却有结果并不是无法计算，请问这是什么原因，换成别的力场就可以，不知道这样的警告对计算有没有影响，谢谢
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1楼 2009-07-03 14:25:01
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
freshgirl(金币+1,VIP+0):谢谢参与~ 7-3 19:52
某个原子可能在该力场中没有相应的参数，导致整个体系不是电中性
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2楼2009-07-03 17:02:28
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shaopeng6539

★
yjr(金币+1,VIP+0):xiexie!! 7-4 11:25
不是这个问题吧，我用的是discover下的pcff力场，而我的体系只有c,h,o,n这四个最基本的元素，pcff力场是包含这四个最基本原子的
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3楼2009-07-04 09:33:22
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qasd

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
是包含，但是不一定包含所有价态
看看mdf文件里面的原子电荷相加是不是等于零
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4楼2009-07-04 10:13:22
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shaopeng6539

是等于零，再问一下版主，mdf是什么文件，在什么情况下需要看它，不是很明白，谢谢解答
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5楼2009-07-04 11:08:08
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shaopeng6539

可是为什么还能计算呢，计算出的结果对不对呢
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6楼2009-07-04 11:17:34
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
zeoliters(金币+2,VIP+0):感谢回帖交流！ 7-5 11:41
mdf是分子中各原子的连接信息和原子具体力场参数
discover对体系不是电中性有时也能计算，但是某些性质算出来可能不对
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7楼2009-07-04 18:31:59
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shaopeng6539

谢谢版主
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8楼2009-07-05 08:47:50
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