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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】【求助】如何找中间体？
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xiao2008zhu

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】【求助】如何找中间体？

TS搜索时，已经知道反应物和产物，如何得到中间体呢？
新手，请高人多指教。
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1楼 2009-07-02 14:07:58
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yjcmwgk

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yuhuobuku(金币+2,VIP+0):谢谢交流 7-2 21:13
请楼主明确一点：你要找的是中间体还是过渡态？
如果你要找的是中间体，中间体的计算与TS无关
如果你要找的是过渡态，那就看高斯说明书中，对于opt关键字的解释中的qst2，qst3，ts和calcfc四个参数的解释，以及freq关键字中对于虚频的解释

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-7-2 at 15:11 ]
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2楼2009-07-02 15:09:46
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xiao2008zhu

银虫 (小有名气)
楼上的兄台，我要找的是中间体。
我的意思的是，知道了反应物和产物，我怎么知道有没有中间体呢？还有中间体的结构是什么样子呢？


中间体是计算出来的呢？还是要在计算以前，通过资料查到呢？

另外，如果有两个虚频，可不可以以为，在反应物和产物之间有一个中间体啊？
这样就有两个TS了，所以对应着两个虚频？呵呵，小弟刚刚开始学，有说的很白痴的地方，不要见笑。

[ Last edited by xiao2008zhu on 2009-7-2 at 20:34 ]
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3楼2009-07-02 20:26:27
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yjcmwgk

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lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 7-3 14:09
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Originally posted by xiao2008zhu at 2009-7-2 20:26:
楼上的兄台，我要找的是中间体。
我的意思的是，知道了反应物和产物，我怎么知道有没有中间体呢？还有中间体的结构是什么样子呢？
中间体是计算出来的呢？还是要在计算以前，通过资料查到呢？

大部分中间体是“寻思”出来的。反应历程的事儿我常做，基本上，中间体的计算，很多没有实验支持。一般来说，是想一大堆中间体，依靠这些中间体，拟一大堆过渡态。依靠着一大堆中间体和一大堆过渡态，拟一大堆反应历程，慢慢算吧。
有一次我见过两个文献（基本是前后脚的那种，一个问题分两下里说），一共计算了20多条反应路径（内含上百个中间体和更多的过渡态），这才确定了最合适的反应路径。
要算反应历程的话，慢慢算吧，你有的累了

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-7-3 at 13:07 ]
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4楼2009-07-03 13:02:45
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yjcmwgk

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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-3 14:09
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Originally posted by xiao2008zhu at 2009-7-2 20:26:
另外，如果有两个虚频，可不可以以为，在反应物和产物之间有一个中间体啊？
这样就有两个TS了，所以对应着两个虚频？

一般不是这样的。你消一个虚频试试。“如果有两个虚频，就说明反应过程中有两个TS”，这说法基本不靠谱
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5楼2009-07-03 13:09:19
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CKX

木虫 (著名写手)
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Originally posted by yjcmwgk at 2009-7-3 13:09:

一般不是这样的。你消一个虚频试试。“如果有两个虚频，就说明反应过程中有两个TS”，这说法基本不靠谱

如何消一个虚频
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6楼2009-07-05 16:22:09
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yjcmwgk

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Originally posted by CKX at 2009-7-5 16:22:

如何只消一个虚频

跟你正常的消虚频的方法一样一样的
唯一的区别：你消虚频时候，只管一个虚频就行了，对另一个视而不见就是啦
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7楼2009-07-05 16:44:15
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