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erylingjet铁杆木虫 (著名写手)
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【求助】如何做电荷密度图和差分电荷密度图?
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如何做电荷密度图和差分电荷密度图? 望高手赐教!  想要那种平面分布的轮廓图 [ Last edited by erylingjet on 2009-7-2 at 10:55 ] |
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zhou2009
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单个原子的AO的获得，要单算。 如除了算HF外，H和F还要另外单算，而且它们要与HF有同样指定的空间格点规格，且与HF中的H和F有相同的坐标位置，相同的基组。 如果是算整体的ρ来相差，这样得到的三个cube，进入gsgrid作三个xy截面G1、G2、G3，再用HF的G1减去H和F的G2、G3，即得电子密度差。进入sigmaplot作图、调整即得等值线图。 如果想作精细一些，需要在HF中指定一个MO来作，如上面的σ键的MO，它是第3个MO。F也要选定那个单电子的AO，H就是一个了。用指定的MO作三个cube，进入gsgrid作三个xy截面G1、G2、G3，再对这三个xy截面分别作平方使成为电子密度，HF的这个轨道有2个电子，还要乘以2。再用HF的减去H和F的，即得电子密度差。进入sigmaplot作图、调整即得等值线图。 实践表明，因为这时由原子到分子，真正发生电子净变化的主要是σ成键轨道。内层F1s等基本没有变化，相差之后抵消了，而F的孤对电子轨道，虽然因为通过σ键诱导过来部分电子，对有效核电荷的屏蔽加强，使核对孤对电子pi吸引能力减小、能级升高，表现为轨道膨胀、弥散，但由于我们的xy截面是对σ键的中心剖面，对这个截面，孤对电子pz与之是正交的、xy截面是其节点，没有截取到值，另一孤对电子py也因弥散影响甚微。所得到的电子净变化图形，与上面根据σ成键轨道MO作出它的没有原则性的差别。 我下面将传一幅就用整体密度相差作的密度差图，可以与上面精细一些的对照。 [ Last edited by zhou2009 on 2009-7-3 at 15:23 ] |
8楼2009-07-03 15:12:55
2楼2009-07-02 11:20:57
zhou2009
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想来版主是明知故问，意在促进量化图形展示？ 我也有意促进量化图形展示，认为量化图形展示对量化结果应用非常重要，故跟帖造势，以期得到重视、推广。 请见我的帖子： http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1275706&fpage=1 以及我关于此问题的跟帖： http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1280524&fpage=7 建议走g03-gsgrid-sigmaplot的路子。 可以联系我： zhouguo@public.szptt.net.cn QQ:1035329451 海边子 下面是例子： HF分子σ成键的电子密度差图：  [ Last edited by zhou2009 on 2009-7-3 at 08:55 ] |
3楼2009-07-02 14:39:46
zhou2009
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4楼2009-07-02 16:22:38
