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jingwei

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[交流] 基因组科学”（8期/总28期）研习班通知大家有想去的么？

浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院
中国科学院北京基因组所
“基因组科学”（8期/总28期）研习班通知
开班时间： 09年 8 月 21-27 日
上课内容：基因组学、蛋白质组学、系统生物学
上机实习内容：
1.基因组数据注释和分析； 2.核苷酸序列分析； 3.蛋白质结构与功能分析； 4.芯片
数据的基本处理和分析；  5.蛋白质组学数据分析； 6.系统生物学软件实习-网络结构显示与分析。

随着众多模式生物基因组测序项目的完成，生物学数据正在加速度增长。如何应对高通量数据，进行科学地分析和注释，将是当今生物学家们急需学习和解决的问题。
我们将为您提供学术殿堂，请您参加我们举办的“基因组科学”研习班。在这里您将可以听到于军教授（注：于军被《科学美国人》评为2002年度世界科学领袖）亲自主讲的基因组学基础知识和前沿进展。林标扬、杨军教授分别主讲系统生物学和蛋白质组学的研究方法和思路。
我们也将为您邀请经验丰富的胡松年等教授给您细说基因组、蛋白质数据分析、SNP、基因芯片等实验技术的关键事项。
如果您正在从事的研究工作并想进一步提升科学研究水平，不妨来这里倾听浙江大学郑树教授、杨军教授、薛庆中教授分别述说在医学和农学应用中的经验和体会。
如果您想亲自掌握从互联网公共数据库获得数据的方法，学会处理数据、并提炼和挖掘有价值的信息的本领，您更应该来参加我们举办的“基因组科学”研习班。我们为您提供优质服务，每人一台PC机，您可以“跟我学”，紧随大屏幕演示实际操作。上机实习课6次，带你进入基因组科学大门，您将能借助网上的软件、工具，亲手绘制进化大树探讨物种起源，从错综复杂的网络中梳理分子间的相互作用。6天短暂的学习肯定会让您学有所获。再通过我们的教材温故知新，复习巩固。
凡来参加过的学员都把这次学习看作一次极好的“充电”机会。都夸我们研习班认真负责、至今我们已举办27期每期120-140人右，学员遍布全国25余个省市，每次研习班都有近20名教授、研究员参加，更多是硕士生、博士生等年轻学者。也有一些单位带着课题或问题前来交流和联系，他们通过研习班建立了协作关系，共同申请课题，发表论文，其中不少优秀的研究成果，已在SCI期刊上发表。
不学不会，早学早会。有志或有兴趣学习基因组、蛋白质组、系统生物学科研工作者、高校教师及研究生，热烈欢迎您前来杭州参加“基因组科学”研习班。

一、培训班上课内容
上课内容围绕“基因组学－>蛋白质组学－>系统生物学”这条主线来讲述基因组学、蛋白质组学的研究技术方法、基本研究思路、前沿研究进展以及其在各生物学科中的应用。主要内容如下：
1. 基因组学与系统生物学（讲课人：于军教授）
2. 基因组的比较研究（讲课人：于军教授）
3. DNA测序技术原理与进展（讲课人：于军教授）
4. 基因转录组的测定及分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学（讲课人：胡松年教授）
5. 蛋白质组学和系统生物学导论、应用及数据分析（讲课人：杨军教授、王珺博士等）
6. 基因组学、蛋白质组学、系统生物学在医学、农学中的应用（讲课人：郑树、薛庆中教授）

二、培训班上机内容
上机实习课采用 “跟我学”方式，学习生物信息学软件使用，每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。主要内容如下：
实习一：基因组数据注释和功能分析
通过序列比对工具BLAST的学习，了解基因功能注释的原理；介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA3，掌握系统发生树绘制的基本方法；认识基因重复(Gene Duplication)在进化上的功能。
实习二：核苷酸序列分析
利用生物信息学工具进行核苷酸序列分析，包括：基因预测，编码区结构分析，选择性剪切分析，基因启动子预测，基因调控元件预测，密码子偏好性分析等内容，学习基因序列分析常用的数据库和软件。
实习三：芯片的基本数据处理和分析
学习使用TM4软件来实现芯片的数据采集，低质量过滤，标准化处理及聚类等可视化分析。学习使用GenMAPP软件来挖掘芯片数据在代谢途径中的生物学意义。介绍NCBI GEO数据库，学习检索和提交芯片数据。
实习四：蛋白质结构与功能分析
从搜索数据库中感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始，进一步利用网络软件和数据库工具，对蛋白质基本理化性质、二级结构、结构域和三维空间结构进行分析，预测目标蛋白的生物功能。
实习五：蛋白质组学数据分析
介绍蛋白质组学分析软件。利用X！Tandem软件鉴定蛋白质的串联质谱数据，将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白；使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
实习六：系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析
介绍系统生物学软件，展示分子相互作用网络系统，并与基因表达等数据整合，利用Cytoscape系统生物学分析软件，了解和分析蛋白－蛋白相互作用，学习动态表达研究的方法。

欲知详细课表和培训效果请见纳米技术研究院网页：
http://www.zcni.zju.edu.cn/px_xinsheng.php

三、培训对象
从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生。

四、报名方法
如果您对本期研习内容有兴趣，请将以下报名表回执通过E-mail发送到genetrain@zju.edu.cn
或传真至（0571-86971760）。我们会立即回信，并登记在册，6月中旬课表排定后，您将收到详细的教学日程表（包括讲课主题、讲课人、课时等）。待您确认来浙大参加学习后，我们会发给您报到通知并排定上机号。


五、教材
“DNA和蛋白质序列数据分析工具”，薛庆中等编著，科学出版社出版，2008.12发行

六、其他事项

培训地点：杭州  浙江大学华家池校区
收费标准：注册费为￥2400/人（含上机费）, 资料费100元安排食宿、费用自理。
联系人：陈爱华联系电话：13336100452
传真：0571-86971760
电子邮件地址：  genetrain@zju.edu.cn
(请勿直接回复本邮件)

浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院
中国科学院北京基因组研究所

2009年6月1日
附：报名回执

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