| 查看: 6698 | 回复: 3 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
关关雎鸠113新虫 (小有名气)
|
[求助]
ERROR: Numeric index is out of bounds 已有1人参与
|
|
|
我建了8000个水分子模型，弛豫时出现错误 ERROR: Numeric index is out of bounds (../angle_harmonic.cpp:174) Last command: angle_coeff 1 55 104.52 我修改了angle_coeff的系数，错误还在，请各位大神帮我看一下文件哪里错了，非常感谢 in文件和data文件在附件，谢谢 |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : water8000.data
2020-02-27 20:37:18, 1.6 M
» 猜你喜欢
招博士
已经有5人回复
-
青椒八年已不青，大家都被折磨成啥样了？
已经有6人回复
-
救命帖
已经有9人回复
-
青年基金C终止
已经有3人回复
-
26申博求博导推荐-遥感图像处理方向
已经有4人回复
-
限项规定
已经有7人回复
-
西南交通大学国家级人才团队2026年博士研究生招生（考核制）—机械、材料、力学方向
已经有3人回复
-
英文综述是否需要润色及查重
已经有5人回复
-
为什么nbs上溴 没有产物点出现呢
已经有9人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
未名摸鱼猫
金虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 854.2
- 帖子: 570
- 在线: 27.4小时
- 虫号: 19909126
- 注册: 2019-11-26
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
4楼2020-03-05 23:23:19
未名摸鱼猫
金虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 854.2
- 帖子: 570
- 在线: 27.4小时
- 虫号: 19909126
- 注册: 2019-11-26
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2020-02-28 21:45:41
关关雎鸠113
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 418
- 散金: 10
- 帖子: 157
- 在线: 24.8小时
- 虫号: 15361307
- 注册: 2019-06-17
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
送红花一朵 |
是的，第二列是分子编号。in文件补上，希望可以看一下错误在哪里，谢谢 dimension 3 boundary p p p units real atom_style full read_data water8000.data neighbor 2 bin neigh_modify delay 0 every 1 pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.1546 8.5 pair_coeff 1 * 0 0 pair_coeff 2 2 0.1852 3.1589 bond_style harmonic bond_coeff 1 450 0.9527 angle_style harmonic angle_coeff 1 55 104.52 kspace_style pppm/tip4p 1.0e-4 minimize 1.0e-4 1.0e-6 100 1000 fix 1 all shake 0.0001 20 10 b 1 a 2 variable t equal 300.0 velocity all create ${t} 12345 rot yes mom yes dist gaussian thermo 100 thermo_style custom step cpu etotal ke pe evdwl ecoul elong temp press vol density dump 1 all atom 100 dump.lammpstrj fix 2 all npt temp $t $t $(100*dt) iso 1 1 800 timestep 1 run 20000 write_restart restart1.file |
3楼2020-03-05 15:06:38