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lilyjiang5

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】跪求各位达人给点意见(about MS)

我最近刚刚开始上手 material studio。 当我construct 了一个polymer 单体,然后设定单体数量为20 建立了一个polymer 然后我把polymer 放到一个box中的时候遇到了难题,box 怎么都建不起来,说是输入有问题,当我把polymer 链长减小到4 的时候才能建立box,但是这个链长又太短了,各位同志们有没有遇到过类似的问题,我该怎么办呢,急死了,给我点意见吧,谢谢各位达人。

[ Last edited by zeoliters on 2009-11-13 at 14:30 ]
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tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
gwdavid(金币+3,VIP+0):欢迎交流 6-30 11:14
首先,不用跪求,男儿膝下有黄金,求大家帮忙就帮忙,干吗用这么个词。

我不用ms,我也不用软件,我是自己写代码来计算,不太懂软件

不过我想问下你建立的box的大小是多少?链长度又是多少呢 ?

在我的代码里面有个默认的规则就是链长度不能超过box一半的长度,我不知道软件里是不是也有这个限制。

你最好check下。

cheers
2楼2009-06-30 06:30:07
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lilyjiang5

新虫 (初入文坛)

谢谢回复的这么快,呵呵,好的,以后我不用这个词了,不过我不是男生啦:)

我的box 的大小是 34A,链长。。。我看看啊,但是box的大小的自动根据polymer的情况确定的,似乎不能修改的。。。
3楼2009-06-30 08:28:29
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qphll

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
xuefei06(金币+1,VIP+0):3Q! 6-30 14:18
叹息,女生就更不能跪求了,如果你是冰天雪地的那种室外LUO跪求,那就更要不得了. :--)

我的感觉不一定准,但是如果你能将你的20单体的polymer命名成一个分子,然后在construct的时候,选择这个分子生成盒子,设置好需要得到的体系密度,那么ms是会自动替你生成合适的盒子的,可以选择cubic的,也可以选择长方体的.

大概查查ms自带的tutorial关于建模部分,应该就可以找到答案.
Life, Love, Laugh.
4楼2009-06-30 14:14:32
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farawaygoing

木虫 (著名写手)

木虫之虫


yuhuobuku(金币+1,VIP+0):谢谢交流 7-2 17:23
文献看多了就知道了,没有基础是不行的
5楼2009-06-30 14:36:02
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lilyjiang5

新虫 (初入文坛)

谢谢qphll,呵呵,我读了自带的指导手册,但是没有讲这种情况~~~我就是按照你描述的情形做的,但是就是construct不出来,当我减少链长的时候才能构建出来,我不明白这是为什么呢?
6楼2009-07-01 00:09:19
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