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majun04

木虫 (著名写手)

majun

[交流] 【讨论】气相中结构优化成功,溶剂中产生虚频

诸位,在气相中,优化结构已经收敛,然后加入溶剂效用以后,结构有很小的虚频。请问这个很小的虚频一般是采用什么办法能够有效的消除?

计算文件参数调用如下:
# opt=(calcfc) freq=noraman rb3lyp/6-31g(d) geom=allcheck guess=read nosymm scrf=(iefpcm,solvent=acetonitrile)

虚频对应着甲基上的氢原子转动。

诸位谈一下经验吧。

[ Last edited by majun04 on 2009-6-28 at 08:48 ]
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sam1868

★ ★ ★ ★ ★ ★
majun04(金币+1):谢谢参与
majun04(金币+2,VIP+0):这个“消不掉也不会对能量有很大影响”,要是用来发文章用的数据,审稿人会不会提出质疑啊。 6-28 11:34
yuhuobuku(金币+3):谢谢交流
甲基上的虚频能消则消消不掉也不会对能量有很大影响,甲基的转动时很容易的,小消虚频的方法与气相中的一样,按虚频振动的方向调整结构后再优化。
另外,calcfc是很费时的,opt时我以为完全没有必要。
2楼2009-06-28 11:03:52
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sam1868


majun04(金币+1,VIP+0):以前写文章算得是气相的,定点都是没有虚频的,这个溶剂中的虚频还真是麻烦。 6-28 20:18
我觉得既然甲基转动需要的能量很小,对总能量的影响应该很小,行内人应该不会有太大疑义, 在文章中如实说明一下即可。
3楼2009-06-28 18:16:13
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

★ ★
yuhuobuku(金币+2):谢谢交流
调整甲基的二面角以后,优化,虚频消除,呵呵。
乐观、执着、勤奋
4楼2009-06-29 10:36:03
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

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majun04(金币+1):谢谢参与
majun04(金币+1,VIP+0):谢谢你 6-29 16:01
yuhuobuku(金币+3):谢谢交流
引用回帖:
Originally posted by sam1868 at 2009-6-28 11:03:
这个“消不掉也不会对能量有很大影响”,要是用来发文章用的数据,审稿人会不会提出质疑啊。。

如果你的虚频的绝对值小于10 cm-1,
强度也小于“该分子中最强的红外振动峰的峰高的百分之一”
那你就可以忽略它
如果审稿人提出质疑
你完全可以向编辑部提请抗辩
最后的胜利一定是你的
5楼2009-06-29 13:30:04
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