| 查看: 579 | 回复: 0 | ||
shuiquangou金虫 (正式写手)
|
[求助]
基因组序列注释
|
|
研究的物种已经测序，但基因组组装还不完善。现在基因组注释信息有预测的转录本和同源注释信息，但未向其它测序物种那样直接给出编码的氨基酸和cds序列。现有基因的转录本序列（包含UTR，但未注明UTR位置）、文献中给出的bed12文件（转录本位置，转录本各exons起始位置），如何得到与bed12文件相一致的氨基酸序列和cds序列？有什么软件可以实现么？ 注：同一基因位置可能存在多个转录本，利用getorf或orf-finder处理会出现不同转录本一个cds情况，transdecorder预测的又与文献中的结果有出入，在尊重原文献研究成果情况下，如何得到相应的所有cds？ |
回复此楼» 猜你喜欢
免疫学博士有名额，速联系
已经有12人回复
-
面上基金申报没有其他的参与者成吗
已经有4人回复
-
退学或坚持读
已经有16人回复
-
青椒八年已不青，大家都被折磨成啥样了？
已经有16人回复
-
国家基金申请书模板内插入图片不可调整大小?
已经有8人回复
-
多组分精馏求助
已经有6人回复
-
国家级人才课题组招收2026年入学博士
已经有6人回复
-
交叉科学部支持青年基金，对三无青椒是个机会吗？
已经有7人回复
