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xujun0309369

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】高斯计算中的两个问题

我做的是卟啉类化合物的计算,有70多个原子,想计算它的频率和TD轨道,可在算的时候遇到两个棘手的问题
1.进行频率计算的时候,结构优化好后算FREQ时,程序老是在l1002上停着,10来天也算不过去,用的是下面的机组
%rwf=D:/job1,2GB,job2,2GB,job3,2GB,E:/job4,2GB,job5,2GB,job6,2GB,F:/job7,2GB,jobn,-1
%Chk=tpp-zn
%Mem=1000MB
#P RB3LYP/6-31G(d) Opt Freq=Raman test
2.优化好的结构做TD计算时,程序也经常在l914上停滞不前
这是算到最后的信息
Davidson failed to converge within maximum sub-space dimensions.
  Restart with updated initial guess:
Iteration     1 Dimension   128 NMult  5760
Cannot handle 2e integral symmetry, ISym2E=1.
CISAX:  IP=  1 NPass=   3 NMax=  43.
CISAX will form  43 AO SS matrices at one time.

[ Last edited by xujun0309369 on 2009-6-25 at 09:20 ]
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S07111072

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
xujun0309369(金币+1,VIP+0): 6-25 10:59
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 6-26 13:11
楼主的体系较大,而且Freq 和TD计算本来很费时,很长时间停止在L1002和L914这很正常,你可以在G03temp临时文件下看看计算是否还在进行
2楼2009-06-25 10:46:09
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xujun0309369

银虫 (小有名气)

15天以上也是正常的?
3楼2009-06-25 10:56:38
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szmeng

至尊木虫 (文坛精英)

★ ★
xujun0309369(金币+1,VIP+0): 6-25 11:06
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-26 13:11
楼主机子配制如何?1002频率分析停机,可能是内存小。
4楼2009-06-25 11:03:09
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xujun0309369

银虫 (小有名气)

微机上算的,1G内存,但在linux下2个CPU算也存在这样的问题
5楼2009-06-25 11:06:19
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)


xuefei06(金币+1,VIP+0):3Q! 6-25 16:24
从你给出的信息来看,还没有出错

由于体系较大,所以时间长是很正常的。如果在 Linux,用 top 看一下相应的程序是否还活着……
6楼2009-06-25 12:04:34
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★
xujun0309369(金币+1,VIP+0): 6-25 15:04
erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 6-25 21:26
我也做卟啉类的计算,我直接用塔式服务器算。
楼主可以跟老板申请买两个主机(不用买显示器键鼠等等),每台双核cpu+4G内存,做一个小的分布式PC群。用ssh跟这个小PC群通讯即可。
两个主机也不过6000银子。关于PC群的组件,如果楼主感兴趣,可以参考这个帖子http://blog.xiaonei.com/GetEntry ... &owner=33276318
7楼2009-06-25 12:36:56
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xujun0309369

银虫 (小有名气)

能否用你那的仪器帮我计算,谢谢
8楼2009-06-25 15:06:16
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szmeng

至尊木虫 (文坛精英)


erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 6-25 21:27
楼主用将优化的构型,改用小基组频率分析试试。
9楼2009-06-25 16:43:58
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

引用回帖:
Originally posted by xujun0309369 at 2009-6-25 15:06:
能否用你那的仪器帮我计算,谢谢

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10楼2009-06-26 11:07:16
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