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hours2089

[交流] 【求助】DMOL3中如何知道原子对HOMO和LUMO的贡献比例是。

用MS4.4-dmol3计算完分子的HOMO和LUMO后,看哪里才能看到每个原子对轨道的贡献是多大。我点选了population analysis,可是不知道一堆数据里哪个是说明原子对HOMO或LUMO的贡献比例。
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hours2089

我在input文件中加入了命令行#print eigenvectors. 打开输出文件,数据量太大了。也找到了MO coefficient那一块,但是数据量奇大无比,怎么计算某一个取代基对HOMO或LUMO轨道贡献呢?
   输出文件存成.txt文件有好几个M。

[ Last edited by hours2089 on 2009-6-25 at 02:02 ]
2楼2009-06-24 23:37:31
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hours2089

输出文件的第二部分。
3楼2009-06-24 23:38:04
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hours2089


yjr(金币+1,VIP+0):鼓励一下 6-25 12:02
奋战了三个小时,总算明白了一点点怎么才能找到HOMO和LUMO轨道的MO coefficient.
可是还是有一些不太明白的,比如要计算一下某一个到代基对HOMO轨道贡献的百分比怎么计算。轨道组合系数有的是正值有的是负值。怎么计算一个取代基对整个HOMO轨道的贡献百分比呢?是不是把取代基相应的原子的轨道组合系数(不管正负全部按正值计算)都加起来除以所有轨道的组合系数的加和(不管正负全部按正值计算)。
不知道理解的对不对。
4楼2009-06-25 01:59:10
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deadbook

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjr(金币+2,VIP+0):谢谢!! 6-25 12:02
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 6-25 18:41
关于取代基百分比的问题,你可以看下这篇文献,里面有比较详细的说明。我本来也想去计算百分比的,无奈dmol用的是数值基组,而且基组的信息是不公开的没办法知道他们之间的交叠积分,所以最后只好放弃了。
5楼2009-06-25 08:28:19
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xiekf1985

木虫 (正式写手)


wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 6-25 18:42
PDOS可以吧
6楼2009-06-25 09:39:34
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hours2089

不是简单的加减乘除问题啊? 我看到有的文章上提到过某一基团对整个HOMO贡献的百分比,好象是用高斯计算的。但不有说是怎么计算的,只给出了百分比。
这可怎么办啊!
7楼2009-06-25 11:44:02
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qscao

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
freshgirl(金币+1,VIP+0):谢谢参与 6-26 11:36
可以算的,你用LINUX下的dmol3,最终out文件中有每个原子岁各个轨道的贡献比率
8楼2009-06-26 10:30:30
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hours2089

qscao同志:
       windows下的dmol3的out 文件里有没有?
9楼2009-06-26 11:35:02
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