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xiaofang9826

铜虫 (初入文坛)

[交流] 载体序列错误

载体序列错误

各位大虾 ,本人在做沉积物微生物多样性,构建了16s rDNA文库,用的载体是pMD18-T,但是在测序的时候发现测出来的载体序列是错误!和原载体序列有很大的出入??敢问这是为何啊??、我的这个库还能用吗??
不胜感激!!!~
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amisking

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2楼2009-06-21 15:57:33
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dyyyyy

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不一定是错误,与序列方向有关,建议你先利用NCBI上的blast比一下,就差不多了
3楼2009-06-21 16:03:02
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xiaofang9826

铜虫 (初入文坛)

o ~~~
反方向找不到的 ~~~
奥科测所有样品的前面四十碱基(疑似载体的)是完全一样的,但和已知载体序列不一样~~只是和插入序列挨着的六个碱基是与已知的载体序列一样
4楼2009-06-23 12:31:06
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