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【求助】第一性原理计算所需通讯量大不大?
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有这样两个方案想请各位专家评估一下。打算作两个节点的小集群，每一个是双CPU4核，第一个方案是用XEON5430的两台，用双千兆连接。另一个方案为XEON5420的两台，用INFINIBAND连接。这两个方案哪个算Materials-studio和VASP更快呢？ [ Last edited by freshgirl on 2009-6-19 at 22:35 ] |
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condensed
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minsong(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1,VIP+0):xiexie 6-18 20:27
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兆以太网与Infiniband双雄并举 互联―――千兆以太网与Infiniband双雄并举 ',RbG Z I 网络是集群中各个节点相互连接和协同工作的基础。在实际的集群系统中，通常采用有两套彼此独立的网络。一套是普通百兆以太网，用于系统管理和文件服务等普通网络通信,另一套是高速网，主要负责并行计算的消息传递和数据交换。在TOP500中，集群的高速网主要有Gigabyte Ethernet、10Gb Ethernet、Myrinet、Infiniband、PathScale的Infinipath、IBM的SP网络、Dolphin SCI、SGI的Numa－Link、Gray的RapidArray等。而集群中使用最广泛的高速通信网络为千兆以太网和Infiniband。 %\%,wOb; 在2006年的TOP500中，Gigabit Ethernet（千兆以太网）仍然是使用最多的系统互连网络，但采用数量已经从6个月前的256台下降到213台。而采用InfiniBand技术的系统则从6个月前的36台增长为78台，显示出该网络的强劲发展势头。 XP Z {x 采用千兆以太网的优势在于：千兆以太网提供10倍于快速以太网的传输交换性能，并与现有的10/100Mbps以太网标准、CSMA/CD协议完全兼容，同时千兆以太网支持以太网、快速以太网的802.1QVLAN标准、802.1p优先级标准及802.3x流量控制协议，而将使企业能够在升级至千兆性能的同时，保留现有的线缆、操作系统、协议、桌面应用程序和网络管理战略与工具；千兆以太网具有更有效的带宽优势，并且具有良好的发展空间，10G以太网技术与基于以太网帧层及IP层的优先级控制机制和协议标准及QOS支持技术日趋成熟，为高要求服务质量提供了保证基础。 Ca V#AKT> Infiniband 完备的通信协议和网络底层的实现技术借鉴了以太局域网、光纤通道存储网络和广域网络的研究经验，因此具有很强的通用性。由于Infiniband具有工业标准、10Gb/s高性能的互联、RDMA、成本低廉、高QoS和RAS性能等诸多特点，得到了越来越广泛的应用。InfiniBand总线拓扑结构是基于分组交换点到点连接的fat tree结构，有很好的扩展功能。它既能以PCB的形式提供芯片与芯片的互联，还能以电缆线的形式提供“out of the box”设备与设备之间的互联。每个单独的链接通道是４根信号线组成的双向数据通道，双向理论带宽是5Gb/s。InfiniBand体系结构中包含5个基本层，自下向上依次是物理层、数据链路层、网络层、传输层和上层软件应用层，其中前4层是通过硬件完成的。在InfiniBand结构中还单独定义了一个Subnet Manager的概念，它用来配置网络单元、错误报告、链接错误排除、机箱管理等等。Infiniband每个单独的链接通道是４根信号线，２根输入、２根输出，每个数据方向是2.5Gb/s的带宽，目前的DDR方式能够达到单通道单方向5Gb/s带宽，在DDR方式下的双向带宽是10Gb/s。而且不同的通道之间还可以进行组合成为一个端口，这样带宽就可以成倍的增长。由于目前Infiniband支持到DDR，所以最高的理论带宽是60Gb/s。 BawXgLCG8d 近几年来TOP500中上述三种网络的数量变化，从中可以看出，Myrinet作为经典的高速网络在TOP500中一直占有较大份额，但2005年被迅速增长的千兆以太网超过；而Infiniband方兴未艾，从2003年出现以来，每年以大约三倍速增长，发展势头甚至超过了千兆以太网。可以预测，未来几年Infiniband将成为集群高速网络的增长点。 |
2楼2009-06-18 09:36:01
woshilaoer8381
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6楼2009-06-18 11:52:38
