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blizzard1506

[交流] 关于终止子预测分析的问题

最近想扩增一个基因的终止子,想问下,有没有终止子分析的软件啊,就像启动子分析软件那样的,希望大家能推荐个终止子分析软件,或是文献也行,急用,谢谢。
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dyyyyy

铁杆木虫 (著名写手)


blizzard1506(金币+1):谢谢参与
终止子还是终止序列?
2楼2009-06-18 07:48:32
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


blizzard1506(金币+1):谢谢参与
帮顶,呵呵
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2009-06-18 10:04:46
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bioinflab

银虫 (小有名气)

★ ★
blizzard1506(金币+1):谢谢参与
blizzard1506(金币+1,VIP+0):谢谢你 6-18 23:07
细菌的转录终止子可以通过下列软件来预测:transterm 以及RNAmotif
4楼2009-06-18 10:49:43
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amms_8

新虫 (小有名气)

★ ★
blizzard1506(金币+1):谢谢参与
blizzard1506(金币+1,VIP+0):谢谢 6-18 23:07
RNAmotif 肯定可以
5楼2009-06-18 10:52:01
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生物之渊

铜虫 (小有名气)


blizzard1506(金币+1):谢谢参与
三楼可以
6楼2009-06-18 12:07:22
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ilaveu

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
blizzard1506(金币+1):谢谢参与
blizzard1506(金币+2,VIP+0):谢谢你 6-18 23:04
引用回帖:
Originally posted by dyyyyy at 2009-6-18 07:48:
终止子还是终止序列?

终止子就是终止序列!
你是不是把终止密码子和终止子搞混了?

楼主的问题,我觉得如果是已经公布的基因,那么网上可能会有其终止子
如果是新基因,那么这个基因后面大约500bp-1kb内就差不多算终止子吧?
7楼2009-06-18 12:30:04
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blizzard1506

谢谢大家,我把我的问题在说清楚些。
我在做启动子功能的验证,做一个食用菌的遗传转化系统,现在扩增得到了一个酶基因A的启动子序列,现就是要证明这个启动子可以启动某个基因B的表达,实现同源表达,后期就是想用这个启动子来启动表达我想要的某些酶的基因。

现在就是要做这么一个表达盒,用我的扩增得到的启动子连接上一个抗性基因在加上终止子序列,构建这么一个载体。

我想用的终止子序列就是这个酶基因A的终止序列。

终止子不难扩增,现在就是不知道终止子序列有什么特征,要多长才能达到终止转录的功能,网上查了,说的都不具体,文献也没少,所以就请大家帮帮忙,感谢各位回帖。谢谢!
8楼2009-06-18 23:03:52
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anquren

金虫 (正式写手)


blizzard1506(金币+1):谢谢参与
到基因组序列数据库中应该也可以吧
9楼2009-06-19 09:45:37
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ilaveu

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by blizzard1506 at 2009-6-18 23:03:
谢谢大家,我把我的问题在说清楚些。
我在做启动子功能的验证,做一个食用菌的遗传转化系统,现在扩增得到了一个酶基因A的启动子序列,现就是要证明这个启动子可以启动某个基因B的表达,实现同源表达,后期就是想 ...

500bp
够用了
10楼2009-06-19 13:02:42
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