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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于终止子预测分析的问题
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blizzard1506

[交流] 关于终止子预测分析的问题

最近想扩增一个基因的终止子，想问下，有没有终止子分析的软件啊，就像启动子分析软件那样的，希望大家能推荐个终止子分析软件，或是文献也行，急用，谢谢。
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1楼 2009-06-18 01:03:33
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dyyyyy

铁杆木虫 (著名写手)
★
blizzard1506(金币+1):谢谢参与
终止子还是终止序列？
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2楼2009-06-18 07:48:32
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
★
blizzard1506(金币+1):谢谢参与
帮顶，呵呵
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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2009-06-18 10:04:46
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bioinflab

银虫 (小有名气)
★ ★
blizzard1506(金币+1):谢谢参与
blizzard1506(金币+1,VIP+0):谢谢你 6-18 23:07
细菌的转录终止子可以通过下列软件来预测：transterm 以及RNAmotif
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4楼2009-06-18 10:49:43
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amms_8

新虫 (小有名气)
★ ★
blizzard1506(金币+1):谢谢参与
blizzard1506(金币+1,VIP+0):谢谢 6-18 23:07
RNAmotif 肯定可以
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5楼2009-06-18 10:52:01
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生物之渊

铜虫 (小有名气)
★
blizzard1506(金币+1):谢谢参与
三楼可以
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6楼2009-06-18 12:07:22
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ilaveu

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
blizzard1506(金币+1):谢谢参与
blizzard1506(金币+2,VIP+0):谢谢你 6-18 23:04
引用回帖:
Originally posted by dyyyyy at 2009-6-18 07:48:
终止子还是终止序列？

终止子就是终止序列！
你是不是把终止密码子和终止子搞混了？

楼主的问题，我觉得如果是已经公布的基因，那么网上可能会有其终止子
如果是新基因，那么这个基因后面大约500bp-1kb内就差不多算终止子吧？
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7楼2009-06-18 12:30:04
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blizzard1506

谢谢大家，我把我的问题在说清楚些。
我在做启动子功能的验证，做一个食用菌的遗传转化系统，现在扩增得到了一个酶基因A的启动子序列，现就是要证明这个启动子可以启动某个基因B的表达，实现同源表达，后期就是想用这个启动子来启动表达我想要的某些酶的基因。

现在就是要做这么一个表达盒，用我的扩增得到的启动子连接上一个抗性基因在加上终止子序列，构建这么一个载体。

我想用的终止子序列就是这个酶基因A的终止序列。

终止子不难扩增，现在就是不知道终止子序列有什么特征，要多长才能达到终止转录的功能，网上查了，说的都不具体，文献也没少，所以就请大家帮帮忙，感谢各位回帖。谢谢！
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8楼2009-06-18 23:03:52
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anquren

金虫 (正式写手)
★
blizzard1506(金币+1):谢谢参与
到基因组序列数据库中应该也可以吧
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9楼2009-06-19 09:45:37
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ilaveu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by blizzard1506 at 2009-6-18 23:03:
谢谢大家，我把我的问题在说清楚些。
我在做启动子功能的验证，做一个食用菌的遗传转化系统，现在扩增得到了一个酶基因A的启动子序列，现就是要证明这个启动子可以启动某个基因B的表达，实现同源表达，后期就是想 ...

500bp
够用了
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10楼2009-06-19 13:02:42
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