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huabangou

[交流] 【求助】新手求助高斯几何优化的问题

本人是新手,对磷酸镧进行几何优化,建了很多结构都不成功,主要是不收敛,能量没有出现震荡,希望高手给予指点.输入文件如下:
%chk=24conventional cell.chk
%mem=300MW
%nproc=1

# B3LYP/LanL2DZ opt test

Title Card Required
01
La                 0.00000000    1.49648495    2.12686250
La                 0.00000000    6.46932505    6.38058750
La                 3.93761000    5.47938995    2.12686250
La                 3.93761000    2.48642005    6.38058750
P                  5.28300573    0.00000000    4.25372500
P                  5.28300573    7.96581000    4.25372500
P                  6.52982427    3.98290500    8.50745000
P                  6.52982427    3.98290500    0.00000000
O                  0.47592026    2.75509384    4.03856895
O                  0.47592026    5.21071616    4.46888105
O                  2.21588310    4.18761771    3.01245189
O                  2.21588310    3.77819229    5.49499811
O                  5.65933690    4.18761771    1.24127311
O                  5.65933690    3.77819229    7.26617689
O                  3.46168974    1.22781116    8.29229395
O                  3.46168974    6.73799884    0.21515605
O                  1.72172690    0.20471271    1.24127311
O                  1.72172690    7.76109729    7.26617689
O                  4.41353026    1.22781116    4.46888105
O                  4.41353026    6.73799884    4.03856895
O                  7.39929974    5.21071616    8.29229395
O                  7.39929974    2.75509384    0.21515605
O                  6.15349310    7.76109729    5.49499811
O                  6.15349310    0.20471271    3.01245189
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S07111072

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
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yuhuobuku(金币+2,VIP+0):谢谢交流 6-17 18:03
楼主优化时是怎么不收敛啊,如果构型没有问题,可以改变波函数的初始猜测,如Guess=indo
2楼2009-06-17 16:20:39
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★ ★ ★
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yuhuobuku(金币+4,VIP+0):谢谢交流 6-17 18:03
首先你给出的输入文件格式有问题,不知道你在计算中是否就是用这样的文件
其次你搭的结构也有问题,哪有那么多氧原子堆在一块儿的

另外你给的信息太少了,
计算出错了吗?
如果出错了,贴出输出文件最后的出错信息
如果没有出错,需要贴出不收敛的信息,
在你的输出文件中查找“Threshhold” 字段,找到最后一个
将其下面的四行贴出来,
顺便看看最后几个“Threshhold” 字段下面的情况

看你的chk文件的名字,好像还用了cell
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
3楼2009-06-17 16:59:39
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)


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Guess=indo

有什么用啊?
4楼2009-06-17 21:02:54
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orangedp6597

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
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yuhuobuku(金币+2,VIP+0):谢谢交流 6-18 07:56
你的分子中有金属,应该用使用赝势的输入文件,具体参照高斯说明。
5楼2009-06-18 01:49:35
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★
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yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:25
引用回帖:
Originally posted by orangedp6597 at 2009-6-18 01:49:
你的分子中有金属,应该用使用赝势的输入文件,具体参照高斯说明。

他用的就是赝势啊,只不过是全赝势基组。他的输入格式是对的
6楼2009-06-18 13:07:04
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★
yuhuobuku(金币+3,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:26
引用回帖:
Originally posted by erylingjet at 2009-6-17 21:02:
Guess=indo
有什么用啊?

Guess=indo的意思是:使用Gaussian98的默认初始猜测:对第一行元素是INDO,第二行元素是CNDO,第三行及以后的元素是Huckel。
如果不写Guess=indo,则使用Gaussian03的默认初始猜测:全部使用Huckel初始猜测。
Guess=indo的用处:使比较差的初始构型,能比较顺利地通过初始猜测。
想不到楼主的输入文件写的一塌糊涂,却居然知道Guess=indo!

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-6-18 at 13:11 ]
7楼2009-06-18 13:10:36
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★
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yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:27
引用回帖:
Originally posted by huabangou at 2009-6-17 15:11:
本人是新手,对磷酸镧进行几何优化,建了很多结构都不成功,主要是不收敛,能量没有出现震荡,希望高手给予指点.输入文件如下:
%chk=24conventional cell.chk
%mem=300MW
%nproc=1

# B3LYP/LanL2DZ opt t ...

你的计算根本上就行不通。LanL2DZ方法,处理La,误差相当大。对于稀土元素来说,LanL2DZ仅仅对Y还算有一定准确度(参看ChemPhysChem 2008, 9, 781-792和ChemEurJ2007,13,9503-9514)。但是对于La的准确度就太低了(参看JPCA,2007,111,392-400)建议采取SDD(如果你的资源比较多)或CEP-121G(如果你的资源比较少)
8楼2009-06-18 13:30:21
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gaochao85

铜虫 (正式写手)


yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:27
SDD 确实比较准确
9楼2009-06-18 13:59:49
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huabangou

非常感谢大家的回帖,我也知道问题,所以才拿出来让大家帮着看看,太感谢你们了
下面是最后三个Threshold的值,还请大家帮忙分析:
     Item                                Value     Threshold  Converged?
Maximum Force                0.093072     0.000450     NO
RMS     Force                    0.022360     0.000300     NO
Maximum Displacement    0.074187     0.001800     NO
RMS     Displacement        0.016424     0.001200     NO
Predicted change in Energy=-5.518068D-02

         Item                             Value     Threshold  Converged?
Maximum Force                 0.082378     0.000450     NO
RMS     Force                     0.020155     0.000300     NO
Maximum Displacement     0.010794     0.001800     NO
RMS     Displacement         0.002636     0.001200     NO
Predicted change in Energy=-2.249731D-05

         Item                              Value     Threshold  Converged?
Maximum Force                 0.084392     0.000450     NO
RMS     Force                     0.020264     0.000300     NO
Maximum Displacement     0.199430     0.001800     NO
RMS     Displacement         0.062802     0.001200     NO
Predicted change in Energy=-3.685631D-03

[ Last edited by huabangou on 2009-6-18 at 15:42 ]
10楼2009-06-18 15:19:30
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