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mimengyu

铜虫 (初入文坛)

[交流] 细菌的16s比对

请问细菌的16s比对时为什么有的公司用rdp数据库比对啊?有什么好处?和blast有什么区别?哪个更好一些啊?

[ Last edited by 350784478 on 2009-8-17 at 17:10 ]
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dyyyyy

铁杆木虫 (著名写手)

不太清楚,我一直用ncbi的blast
2楼2009-06-17 10:39:52
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ym3612003

铁杆木虫 (著名写手)

修己 慎独 思勤

一般ncbi就OK了
但是RDP功能多,比如很重要的一项是做嵌合体检测,这是很有必要做的
最想要去的地方,怎能在半路就返航!!!
3楼2009-06-17 11:41:20
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mimengyu

铜虫 (初入文坛)

16SrDNA序列也需要嵌合体检测么,上海生工菌种鉴定的比对结果就给发的在rdp上的比对!

[ Last edited by mimengyu on 2009-6-17 at 20:33 ]
4楼2009-06-17 20:27:59
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