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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】能量差值前后矛盾
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...

[交流] 【求助】能量差值前后矛盾

半经验计算的能量差为负，算单点能差值变成正的了。HF 和ｂ３ｌｙｐ单点能差值都是正值。有遇到过这种情况的么。
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
1楼2009-06-16 18:56:56
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子
★ ★ ★
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erylingjet(金币+2,VIP+0):感谢交流 6-16 20:37
显然你算的是2个不同的体系，如果2个体系都用半经验方法做了优化，而后求差值，则不可能发生差值符号的改变，请仔细检查一下。
至于HF和B3LYP的情况，由于方法不同，因此计算得到的能量差是正还是负不具有可比性，除非所使用的2个方法都被证明是非常准确的。
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愿好运与快乐伴随你！
2楼2009-06-16 20:11:34
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):谢谢跟帖交流 6-17 10:13
是同一个体系唉，大哥。A+B——C这个反应的差值。用pm3分别优化三种物质，以及用DFT和HF算优化好的结构的单点能。差值=C-A-B。
如果差值>0，说明反应反方向进行了。用pm3和DFT （DFT 是算的单点能）算出来的能力差的正负不一致这才头疼呢。师兄你明白我的意思啦？
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
3楼2009-06-17 09:07:39
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yuhuobuku(金币+3,VIP+0):谢谢交流 6-17 10:13
明白了你的意思。你的结构优化用的是pm3(体系太大？)，由pm3的优化能量算差值为负，但用另2种方法使用pm3的优化结构计算得到的单点能差值却为正。
原因：一般可能是pm3优化的结构不太可靠。
解决方法：在pm3结构的基础上继续用好方法优化后再计算差值。
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愿好运与快乐伴随你！
4楼2009-06-17 09:33:07
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

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yuhuobuku(金币+1,VIP+0):谢谢跟帖交流 6-17 10:13
我的体系实在很大，除了半经验不能用其他方法了。am1算出来的也是负值。奇怪单点能怎么会是正的呢。
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5楼2009-06-17 09:40:59
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347383257

金虫 (小有名气)
★
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):谢谢跟帖交流 6-17 12:53
用不一样的方法和不一样的机组得出的结果肯定不一样，但是还没遇到过正负号相反的情况呢，呵呵
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风的方向有树决定，人生的方向需要自己决定。
6楼2009-06-17 11:05:38
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

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yuhuobuku(金币+3,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:32
引用回帖:
Originally posted by yyx19840628 at 2009-6-17 09:40:
我的体系实在很大，除了半经验不能用其他方法了。am1算出来的也是负值。奇怪单点能怎么会是正的呢。

那就不要用DFT算单点了。毕竟半经验方法得到的结构有时候不靠谱。有少数时候，DFT会将半经验的方法得到的结构做很大调整。
PM3对共轭体系处理能力比较弱，你的体系中共轭部分多不多，大不大？
Gaussian对PM3做了改进，叫PM3MM，你试试。参见Gaussian说明书中PM3关键字的解释
AM1对共轭体系处理能力更不靠谱，别指望它

或者，你的体系比较大的话，对反应中心用DFT吧，对非反应中心用半经验，参见Gaussian说明书中Oniom关键字的解释

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-6-18 at 14:23 ]
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7楼2009-06-18 14:21:34
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
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yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:32
是分子间作用，本来就很弱。天，现在如果说我做的方法不靠谱，那就死翘翘了。
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
8楼2009-06-18 16:38:24
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
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yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:32
DFT会将半经验的方法得到的结构做很大调整。

单点算是算当前结构下的能量，不会做调整，我没优化。
MS的PBE算单点能得到的能量差是负值。这咋回事啊？
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
9楼2009-06-18 16:39:56
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
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yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:32
引用回帖:
Originally posted by yyx19840628 at 2009-6-18 16:39:
DFT会将半经验的方法得到的结构做很大调整。

单点算是算当前结构下的能量，不会做调整，我没优化。

所以你用DFT算出来的能量很高啊。这就是说：DFT认为你现在的构型很不好
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10楼2009-06-18 18:23:20
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