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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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zzhenry

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】linux下gaussian计算内存%mem设置问题

cpu:8核 内存:32g
在计算不同的分子时 怎么设置%mem=  的问题:

1.看了些帖子,说%mem不是设的越大越好,那具体怎么设置,有什么依据了?
2.在计算时,用dft hf 优化和频率一起做 体系有50多个原子 用6-31g(d) 内存设为4g 算的还算快的。可是换了mp2 方法后 优化过程还行 可是到了频率计算 有几次都给不动了 死机了 mp2/6-311*(d,p) %mem=8g 为什么了?
3.听说mp2方法 内存设置越大越好 是不是?
4.%rwf    linux下,这个我没有设置  环境变量设置后,好像默认是存在scratch文件夹里 我看过 最大时rwf有100g  我的系统是64位 而scratch文件有250g  频率计算时应该没有问题吧?

望虫友给于解答和讨论!谢谢!

[ Last edited by zzhenry on 2009-6-15 at 20:58 ]
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yuhuobuku(金币+3,VIP+0):谢谢讨论 6-16 08:05
以我的经验,dft类方法,500个基函左右的规模,内存设为1g,通常的优化、频率、性质计算已经足够。设得过大的话,程序用不着,结果系统在每次link转换时反复地申请内存,一段时间后又空出来,是会多浪费一点时间,windows下更明显。
mp2方法时内存是越大越好,内存越大,硬盘空间需要的越少,也就节约了磁盘读写时间。mp2计算出问题常常是因为磁盘空间不足。
2楼2009-06-15 22:08:08
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yuhuobuku(金币+3,VIP+0):谢谢讨论 6-16 08:05
这么大的体系还要算MP2的频率,有点晕
MP2计算的内存还是设置的大一点,
要是我在你的电脑上做相同计算我会设置
%mem=25gb
如果基函数(前面的那个basis functions)数量超过550,
频率计算够呛能通过,我计算400多基函数的时候,硬盘都快写到200gb了
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
3楼2009-06-15 22:13:51
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zzhenry

铁虫 (小有名气)

谢谢上面两位虫友!
4楼2009-06-15 22:44:28
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