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汕头大学海洋科学接受调剂
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zhoujun8930

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教关于castep计算的模型构建问题

我从导入的物质晶体结构中,切割出了一个簇结构,现在想用castep对这个簇结构进行结构优化,可是castep要求计算对象具有周期性结构,所以我要建一个周期性的格子把簇结构给包起来,可是在build crystal时,簇结构会被破坏,这是为什么呢?
       如果只是一个分子的话,是完全可以建格子把它包起来的,而且分子结构也不会发生变化,为什么簇结构就不行了呢?请大家帮帮我
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woshilaoer8381

至尊木虫 (知名作家)

★ ★
zhoujun8930(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 6-17 19:38
用Doml吧,这不要求周期!
2楼2009-06-14 11:37:13
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Tower.Tsu

金虫 (著名写手)

★ ★
zhoujun8930(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 6-17 19:39
可能是周期性格子的几何参数设置不当造成的
不再是一个人,处处时时想着念着的都是我们...
3楼2009-06-15 12:05:53
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zhoujun8930

银虫 (小有名气)

可是我选的格子很大


wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 6-17 19:38
我选的最一般的格子,只是为了构造周期型结构,选的也足够大,应该是没问题的
4楼2009-06-15 14:55:32
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375713000

木虫 (正式写手)

★ ★
zhoujun8930(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 6-17 19:39
单个分子当然可以放在晶格里面,castep只能计算周期性的,不用你考虑边界条件,你建立了簇,当然不适用了  再大的格子也是非周期性的   还是前面几个人说的用DMol3
只要我不醒来,世界就不存在
5楼2009-06-16 11:02:51
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zhoujun8930

银虫 (小有名气)

啥意思

,没看懂,呵呵,麻烦你再给我解释下,可能我的表述有误,我并没有建立真正意义上的簇结构,也就是不是用build nanostructure下的nanocluster构建的,我是从晶体结构开始,先构建超晶胞,去掉周期性,然后又剪切出了一定立体形状的结构,我现在就想对这个结构进行优化,看来我还是采纳楼上各位的意见,用dmol3优化吧,谢谢大家的回复
6楼2009-06-16 16:22:29
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woshilaoer8381

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
Originally posted by zhoujun8930 at 2009-6-16 16:22:
,没看懂,呵呵,麻烦你再给我解释下,可能我的表述有误,我并没有建立真正意义上的簇结构,也就是不是用build nanostructure下的nanocluster构建的,我是从晶体结构开始,先构建超晶胞,去掉周期性,然后又 ...

呵呵。没想到我的建议对楼主有用!
7楼2009-06-16 23:43:42
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861015

禁虫 (小有名气)

★ ★
zhoujun8930(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 6-17 19:39
本帖内容被屏蔽

8楼2009-06-17 15:51:23
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zhoujun8930

银虫 (小有名气)

要切割出具有一定形状的结构

如果我不去掉周期性,就没办法切割
9楼2009-06-19 11:19:03
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c25968

铁杆木虫 (著名写手)


zhoujun8930(金币+1):谢谢参与
我现在也正想学这个东西,希望可以快点学号
10楼2009-07-30 16:55:28
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