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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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qingkong0122

新虫 (正式写手)

[交流] 蛋白晶体如何选择 已有1人参与

各位大神好,求问进行分子对接时的蛋白晶体结构如何选择啊?完全不会看PDB中的蛋白晶体的信息啊!求指导,非常感谢!

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qingkong0122

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ks374 at 2020-01-04 01:13:09
这个问题问的很模糊啊。是指在分子计算中如何寻找合适的结合分子吗?是已知这个配体的名字在库里找到很多不知道用哪一个吗?需要怎样的蛋白晶体信息呢?

还有就是如果两个蛋白特别相似的话如何取舍?

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4楼2020-01-04 10:48:56
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ks374

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个问题问的很模糊啊。是指在分子计算中如何寻找合适的结合分子吗?是已知这个配体的名字在库里找到很多不知道用哪一个吗?需要怎样的蛋白晶体信息呢?
2楼2020-01-04 01:13:09
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qingkong0122

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ks374 at 2020-01-04 01:13:09
这个问题问的很模糊啊。是指在分子计算中如何寻找合适的结合分子吗?是已知这个配体的名字在库里找到很多不知道用哪一个吗?需要怎样的蛋白晶体信息呢?

我是想做一个小分子药物与蛋白的分子对接,pdb里同一种蛋白有太多不同的晶体结构了,又不知道如何看它们的信息,比如是人源还是鼠源的?还有不知道哪些信息是主要应该参考的。不知道如何选择,求指导,谢谢

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3楼2020-01-04 10:47:50
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