| 查看: 197 | 回复: 0 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
chene铁杆木虫 (著名写手)
|
[交流]
Mol Genet Genomics：隆线溞孤雌生殖状态基因表达谱研究
|
||
|
Molecular Genetics and Genomics杂志6月发表了中科院北京基因组研究所基因组科学及信息重点实验室与华东师范大学生命科学学院合作的研究成果Analysis and comparison of a set of expressed sequence tags of the parthenogenetic water flea Daphnia carinata。 隆线溞隶属节肢动物门(Arthropoda)、甲壳纲(Crustacea)、鳃足亚纲(Branchiopoda)、双甲目(Diplostraca)、枝角亚目(Cladocera)、溞科、溞属 。隆线溞有两种不同的生殖方式：孤雌生殖(单性生殖)与两性生殖。当外界条件比较适宜时，枝角类就行孤雌生殖。在环境条件恶化时，枝角类就行两性生殖，这时种群中不仅有雌体，同时还出现雄体，二者随即交配。两种生殖方式的交替，是枝角类对外界环境的一种特殊适应，孤雌生殖在有利环境下充分利用了条件，而两性生殖在不利环境下保证了种的生存与连续性。枝角类不但生殖方式特殊，还是一类重要的水生经济动物。它具有较高的蛋白质含量(占干重的40%-60%)，还含有水产经济类动物鱼、虾、蟹等生长发育所必需的氨基酸、维生素及钙质，是生产上十分理想的活体饵料，其产量与渔业生产关系密切。 科研人员对样品随机测序（5′端）3072条，一共得到3,040条高质量的EST序列，并最终得到1,495条unique sequences（465条contigs和1,030条singletons）。通过与公共数据库内的序列进行比对，总共注释了959个（64%）基因。通过基因表达丰度和功能分析（主要是GO和KEGG），对其基因表达谱特征有了全面的认识。其中与生殖和胚胎发育相关的基因共鉴定到57个基因，其中VTN和VTG基因所占比重较高；发现了生殖特异性表达的基因如ubulin alpha chain；另外检测到一些化学感应基因（CSP）和热激蛋白（HSP）基因。推测这些密切感受环境变化的基因在孤雌生殖中起到重要的作用，为以后克隆其全长基因序列并研究功能奠定了基础。 通过与近缘物种蚤状溞（Daphnia pulex）基因组序列的比对，比对之后得到1,283条（86%）unique sequences与其基因组有较高的相似性。其中1,158条比对到基因的编码区域，另外有125条序列比对到基因间区或者内含子区。这些结果从侧面反映了水溞近缘种间（D. pulex和D. carinata）基因组序列、表达水平上的差异，为后续的比较基因组学分析提供了有力的支持。 |
回复此楼» 猜你喜欢
快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。
已经有3人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有9人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有72人回复
-
咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否
已经有26人回复
-
我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人
已经有16人回复
-
有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验）
已经有12人回复
-
招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师
已经有3人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有23人回复
-
filecode=后面第一个是大写字母
已经有7人回复
-
filecode
已经有12人回复
