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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 程序语言 » MATLAB/Mathematica » 马氏距离剔除光谱数据异常值
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张小小旭

铜虫 (小有名气)

[交流] 马氏距离剔除光谱数据异常值

请问大家，我在应用马氏距离剔除光谱数据异常值，我看到关于马氏距离有这样的描述“求在计算马氏距离过程中，要求总体样本数大于样本的维数，否则得到的总体样本协方差矩阵逆矩阵不存在，这种情况下，用欧式距离计算即可”

对于光谱数据来说，一般样本数几百个，每个样本光谱数据超过一千个，我用pdist函数报错显示
错误使用 pdist (line 190)
the covariance matrix for the mahalanobis metric must be symmetric and positive definite.
出错 shishi (line 132)
dist= pdist(x,'mahalanobis')

我看到很多论文是应用马氏距离剔除光谱数据异常值，这种样本数小于样本的维数情况下，是否可以实现马氏距离计算呢？
我的代码如下：

meanx=mean(x); %求均值
[m,n]=size(x);
covx=cov(x);%求协方差矩阵
cov_x=inv(covx);%逆矩阵
for i=1:m
dist(i)=(x(i,: )-meanx)*cov_x*(x(i,: )-meanx)'%求出每个样本到u的马氏距离,
end
dist= pdist(x,'mahalanobis')

x数据120样本，1900吸光度，用定义计算出马氏距离平方有负数，用pdist函数计算报错如上。
谢谢大家共同讨论！
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1楼 2019-12-27 16:17:09
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wlpl

木虫 (小有名气)
★
张小小旭(金币+1): 谢谢参与
要是不用pca降维的话，可以Covx加一个很小的单位阵，保证可逆。

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3楼2019-12-27 17:38:14
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张小小旭

铜虫 (小有名气)
可能是这样的方法《PCA结合马氏距离法剔除近红外异常样品 陈 斌 , 邹贤勇 , 朱文静》
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2楼2019-12-27 17:35:07
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张小小旭

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wlpl at 2019-12-27 17:38:14
要是不用pca降维的话，可以Covx加一个很小的单位阵，保证可逆。

谢谢回复，请问是先求协方差矩阵cov，再加上单位阵，然后求逆矩阵吗？具体是如何加单位阵呢，多谢~
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5楼2019-12-27 19:21:47
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tzynew4楼
2019-12-27 17:39   回复  
张小小旭(金币+1): 谢谢参与
psylhh6楼
2019-12-27 21:11   回复  
张小小旭(金币+1): 谢谢参与
唉尼摸尚靓7楼
2019-12-27 23:53   回复  
张小小旭(金币+1): 谢谢参与
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LWJL20198楼
2019-12-28 10:58   回复  
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miaojiabing9楼
2019-12-30 08:10   回复  
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nono200910楼
2019-12-30 18:41   回复  
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·
星城石墨11楼
2019-12-31 12:00   回复  
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youngen12楼
2019-12-31 12:07   回复  
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reminiscence13楼
2020-04-08 11:34   回复  
张小小旭(金币+1): 谢谢参与
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