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wang1994kang

新虫 (初入文坛)

[交流] 用cDNA克隆cda全长,出现内含子 已有1人参与

用cDNA克隆cds全长,测序结果和cds
相比,cds中间空出一段,其余两段完全一模一样,和基因比对,完全一样。求解释一下,谢谢

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长发小魔女

新虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2019-12-26 22:31:07
或者存在选择性剪切,建议楼主用RACE技术看一下目的基因真正的cDNA全长,我们的基因有一个就是预测的有两个内含子,实际上只有一个。软件预测并不可靠

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3楼2019-12-26 11:01:42
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长发小魔女

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
内含子是用软件预测的吧?不一定准确的,有可能预测得内含子并不是真正的内含子,而是本来就是外显子。

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2楼2019-12-26 10:59:54
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wang1994kang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 长发小魔女 at 2019-12-26 10:59:54
内含子是用软件预测的吧?不一定准确的,有可能预测得内含子并不是真正的内含子,而是本来就是外显子。

用基因组GFF文件

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4楼2019-12-27 09:11:13
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wang1994kang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 长发小魔女 at 2019-12-26 10:59:54
内含子是用软件预测的吧?不一定准确的,有可能预测得内含子并不是真正的内含子,而是本来就是外显子。

而且空出来的一段还有TGA,翻译成蛋白就终止了

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5楼2019-12-27 09:13:01
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