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guyue2885银虫 (正式写手)
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[交流]
关于基因功能注释的~~求助
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看到一个问题,感觉有必要向前人牛人讨论学习一下~~如下: 我看到的一篇文献上将cDNA clones由其with similarity to known genes进行Functional classifications 主要有以下几类:cell cycle/division; general metabolism; photosynthesis; signal transduction; transcription and translation; unknown function. 它只是根据在NCBI上BLAST的结果进行的。这种方法有人会吗?具体是怎么操作的呢? 还有听说Blast2GO和EBI ToolsInterProScan也可以进行功能预测(严格讲应该是功能注释),我琢磨了好久始终有些不懂具体是怎么操作的。不知哪位大侠懂,请不吝指教。 给出两个序列以参照: 序列一: GACTGCGTACCAATTCACTAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCAATAGGGAACGTGAGCTGGGATTAGACCGTCGTGAGAC AGGTTAGTTTTACCCTACTGATGACAATGTCGCAACAGGAATTCAACCTAATACGAGAGGAACCGTTGATTCACACAATT GGTCATGGCGCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGCGAAGCTACCGTGTGCTGGATTATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAAT CCGGGCTAGAAGCGTCGCATGCGCCCGCCGTCCGCTTGCCGACCCGCAGTAGGGGCCTCCGTCCCCCAAGGGCACGTGTC GTTGGCTTAGCCGTCGCGACGGAAGCGTCGCGGCGGCCGCCTTGAAGTACAATTCCCATCGAGCGGCGGGTAGAATCCTT TGCAGACGAGTTACTCATGACTCATC 序列二: GATGAGTCCTGAGTAACGAGATTCCCACTGTCCCTGTCTACTATCCAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAG AATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTTGAGCTTGACTCTAGTCCGACTTTGTGAAATGACTTGAGAGGTGTAGTATAAGTG GGAGCCGAAAGGCGAAAGTGAAATACCACTACTTTTAACGTTATTTTACTTACTCCGTGAATCGGAAGCGGGGCACTGCC CCTCTTTTTGGACCCAAGGCTCGCTCTGCGGGCCGATCCGGGCGGAAGACATTGTCAGGTGGGGAGTTTGGCTGGGGCGG CACATCTGTTAAAAGATAACGCAGGTGTCCTAAGATGAGCTCAACGAGAACAGAAATCTCGTGTGGAACAGAAGGGTAAA AGCTCGTTTGATACTGATTTCCAGTACGAATACGAACCGTGAAAGCGTGGCCTAACGATCCTTTAGACCTTCTGAATTGGTACGCAGTC 正在写论文,急用,谢谢! |
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