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cenxueer

木虫 (正式写手)

[求助] 文献中优化得到两种结构，但是我算完只有一种,请教一下原因？ 已有1人参与

文献中优化得到两种结构，但是我算完只有一种,请教一下原因？
计算的物质为四溴双酚A，分子为C15H12Br4O2，结构如下图（上传不了图片和附件，不知道咋回事，简单说一下就是，两个苯环带有羟基和卤素的对称结构），按着文献中的基组进行优化，关键词设置如下。文献中的羟基上的氢原子有两种构型，一种是氢原子方向相反，成对称结构，另一种氢原子方向相同。我的结果只有相反的这种，且键角跟文献中略有差别，请问是跟关键词设置有关吗？还是我画的初始构型有问题，需要手动调整键角吗？
chk=C:\G09W\Scratch\gv12_3_2019_20_24_00\Preview_wdgzo.chk
#p opt freq b3lyp/6-31+g(d,p) scrf=(smd,solvent=water) geom=connectivity

tbbpa opt freq

0 1
C                 -1.21951227    0.00000000    0.00000000
C                 -0.70389909   -1.45111718   -0.00140847
H                 -1.05897184   -1.95664278    0.87224318
H                 -1.06057396   -1.95551609   -0.87505873
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1楼 2019-12-04 09:57:01
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
高斯优化会从初始结构优化到附近一个比较近的势能低点。如果这两个构型都是相对稳定的。那么你的初始结构接近哪一个构型就会优化到哪一个构型上。如果想要优化到另一个构型。就把初始结构画的更接近另一个构型就行。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

cenxueer
2楼2019-12-04 14:59:14
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cenxueer

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-12-04 14:59:14
高斯优化会从初始结构优化到附近一个比较近的势能低点。如果这两个构型都是相对稳定的。那么你的初始结构接近哪一个构型就会优化到哪一个构型上。如果想要优化到另一个构型。就把初始结构画的更接近另一个构型就行。

非常感谢，明白了，我还想问一下，如果不知道具体存在几种构型的话，能通过优化自己找出多种构型来吗
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3楼2019-12-04 15:27:27
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

一般情况下 找不同的构象是靠自己按不同方式分子摆放自己去搜寻。当然借助分子动力学可以有专门的构象搜索方式。也有一类用扫描分子内单键旋转搜寻因为单键旋转导致的多种构象的。
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4楼2019-12-04 21:54:28
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cenxueer

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-12-04 21:54:28
一般情况下 找不同的构象是靠自己按不同方式分子摆放自己去搜寻。当然借助分子动力学可以有专门的构象搜索方式。也有一类用扫描分子内单键旋转搜寻因为单键旋转导致的多种构象的。

非常感谢
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5楼2019-12-05 09:51:27
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