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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Linux应用 » ubuntu 14.04安装高斯09求助
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llliner1982

铁虫 (小有名气)

[求助] ubuntu 14.04安装高斯09求助已有1人参与

新人求助，

高斯09解压后，设置配置文件，具体如下：

gll@gll-ThinkPad-Edge-E440:~$ source home/gll/g09/bsd/g09.profile
bash: home/gll/g09/bsd/g09.profile: 没有那个文件或目录

gll@gll-ThinkPad-Edge-E440:~$ source gll/g09/bsd/g09.profile
gau-machine：未找到命令

第一次我输入  source home/gll/g09/bsd/g09.profile  显示没有那个文件或者目录
然后我改为输入  source gll/g09/bsd/g09.profile         显示未找到命令

请问是我文件路径有问题吗？还是我的g09.profile文件本身有问题。

感谢感谢。
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1楼2019-12-02 16:16:33
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cyfjkf

至尊木虫 (著名写手)
最有可能的是权限问题

发自小木虫Android客户端
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2楼2019-12-02 20:14:30
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
llliner1982: 金币+5, ★★★很有帮助 2019-12-03 08:46:48
有没有其它的g09 profile的问题 还不好确定. 但是你的路径确实打得不对  最开始的/ 不能省略 也就是 比如说你装在home文件夹下的  应该是 source /home/gll/g09/bsd/g09.profile  不能省略第一个/
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3楼2019-12-03 01:34:49
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llliner1982

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-12-03 01:34:49
有没有其它的g09 profile的问题 还不好确定. 但是你的路径确实打得不对  最开始的/ 不能省略 也就是 比如说你装在home文件夹下的  应该是 source /home/gll/g09/bsd/g09.profile  不能省略第一个/

感谢大神长期以来的帮助
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4楼2019-12-03 08:48:42
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llliner1982

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-12-03 01:34:49
有没有其它的g09 profile的问题 还不好确定. 但是你的路径确实打得不对  最开始的/ 不能省略 也就是 比如说你装在home文件夹下的  应该是 source /home/gll/g09/bsd/g09.profile  不能省略第一个/

老师，您好，我把路径修改正确了，  source /home/gll/gll/g09/bsd/g09.profile     ,但是显示 “gau-machine：未找到命令”，您知道是什么原因吗？
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5楼2019-12-03 10:10:21
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by llliner1982 at 2019-12-02 21:10:21
老师，您好，我把路径修改正确了，  source /home/gll/gll/g09/bsd/g09.profile     ,但是显示 “gau-machine：未找到命令”，您知道是什么原因吗？...

把你具体的安装过程讲讲。怎么设置的环境变量。
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6楼2019-12-03 11:51:40
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paramecium86

版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by llliner1982 at 2019-12-02 21:10:21
老师，您好，我把路径修改正确了，  source /home/gll/gll/g09/bsd/g09.profile     ,但是显示 “gau-machine：未找到命令”，您知道是什么原因吗？...

大概有四个最重要的环境变量要设置,下面是例子 你按照你的电脑的情况来酌情写
可以放在 .bashrc 文件里

g09root=/home                        #这行是g09 所在文件夹
GAUSS_SCRDIR=/home/g09/scratch      #scratch 文件夹路径
export g09root GAUSS_SCRDIR
source $g09root/g09/bsd/g09.profile
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7楼2019-12-03 11:56:38
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llliner1982

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-12-03 11:56:38
大概有四个最重要的环境变量要设置,下面是例子 你按照你的电脑的情况来酌情写
可以放在 .bashrc 文件里

g09root=/home                        #这行是g09 所在文件夹
GAUSS_SCRDIR=/home/g09/scratch      # ...

您好，目前问题解决了，是路径的问题，谢谢

现在能够确定高斯09安装好了，运行任务的时候，比如：g09 < 001.gjf > 001.out   

显示：
PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /g09/scratch/Gau-3641.inp
In source file ml0.f, at line number 195

我看了下好多这种问题，好多老师说是scratch文件路径的问题。
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8楼2019-12-03 15:03:48
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by llliner1982 at 2019-12-03 02:03:48
您好，目前问题解决了，是路径的问题，谢谢

现在能够确定高斯09安装好了，运行任务的时候，比如：g09 &lt; 001.gjf &gt; 001.out   

显示：
PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OP ...

那你查看一下你设定的 /g09/scratch 这个文件夹存不存在 不存在就自己建立一个
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

llliner1982
9楼2019-12-03 23:06:58
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llliner1982

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-12-03 23:06:58
那你查看一下你设定的 /g09/scratch 这个文件夹存不存在 不存在就自己建立一个...

谢谢老师，问题已经解决了

发自小木虫Android客户端
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10楼2019-12-04 09:10:59
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