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单细胞基因组测序和转录组测序 已有1人参与
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| 请问下大家为什么大部分单细胞测序研究都集中在转录组测序?不能在体细胞DNA组发现新的突变吗。还是因为在费用或操作技术分析上有局限性? |
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GRUBBY_WU
铁杆木虫 (著名写手)
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sshhcckk: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 明白了谢谢! 2019-11-20 02:38:46
感谢参与,应助指数 +1
sshhcckk: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 明白了谢谢! 2019-11-20 02:38:46
| 主要还是看目的吧,费用确实有差别,但是单细胞转录组和单细胞基因组测序技术和分析上应该是没什么局限性。转录组测序,主要是测mrna,功能基因;基因组就更大了包括外显子/重复区域/微卫星等等,外显子部分占的比例非常小,所以如果要测基因组就需要很大的数据量,比如人的基因组3G,其中外显子组才30M左右,所以做gws或者wes数据量和测序深度就有很大差别。大部分人关注转录组变化,是因为对表型和功能的影响比较直观,或者说大部分重要的突变集中在转录组上。 |

2楼2019-11-17 17:07:41







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