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柠檬甜死啦

金虫 (正式写手)

[交流] 蛋白-蛋白对接

请问有没有人做蛋白-蛋白的对接？能否指教一下？如果只知道酶和抑制子的氨基酸序列，能做蛋白-蛋白的对接吗？
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1楼 2019-11-15 21:23:13
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小木翔AI

新虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
柠檬甜死啦: 金币+4 2019-12-15 11:11:28
蛋白和蛋白对接有啥用用吗，我有只做过小分子和蛋白对接

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2楼2019-11-15 23:23:59
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
柠檬甜死啦: 金币+6 2019-12-15 11:12:55
先通过模拟构建三维结构，然后做蛋白蛋白对接，用HEX，ZDOCK可以完成

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4楼2019-11-16 10:00:29
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chaohao2010

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
柠檬甜死啦: 金币+8 2019-12-15 11:12:20
先去NCBI看看蛋白质有没有晶体结果解出来，没有的话可以用Swiss-model和itasser建模，然后再用hex或者zdock进行对接

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5楼2019-11-18 09:18:05
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柠檬甜死啦

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小木翔AI at 2019-11-15 23:23:59
蛋白和蛋白对接有啥用用吗，我有只做过小分子和蛋白对接

就是蛋白和抑制子，但是抑制子不是小分子，现在做蛋白与小分子对接的确实很多，所以我想问一下蛋白蛋白对接能不能做呢？好不好做？
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7楼2019-12-15 11:11:15
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普通回帖

anquren

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
柠檬甜死啦: 金币+5 2019-12-15 11:13:32
需要获得两个蛋白的三维结构

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3楼2019-11-16 07:53:40
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l_zk01
★ ★
柠檬甜死啦: 金币+2 2019-12-15 11:12:28


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6楼2019-11-18 10:12:55
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柠檬甜死啦

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by chaohao2010 at 2019-11-18 09:18:05
先去NCBI看看蛋白质有没有晶体结果解出来，没有的话可以用Swiss-model和itasser建模，然后再用hex或者zdock进行对接

谢谢你
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8楼2019-12-15 11:12:15
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柠檬甜死啦

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by l_zk01 at 2019-11-18 10:12:55
9楼2019-12-15 11:12:36
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小木翔AI

新虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 柠檬甜死啦 at 2019-12-15 11:11:15
就是蛋白和抑制子，但是抑制子不是小分子，现在做蛋白与小分子对接的确实很多，所以我想问一下蛋白蛋白对接能不能做呢？好不好做？...

受教

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10楼2019-12-15 11:12:43
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