24小时热门版块排行榜    

查看: 4956  |  回复: 35
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

charon1982

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 做原核(细菌)鉴定(新种)的看看,识货的绝对有用! 已有12人参与

本人介绍一个网站 EzTaxon server 2.1
这是做细菌16S鉴定的一个网站:
http://147.47.212.35:8080/

简要介绍一下其要点和特点:
1.其专门介绍此网站的文章发表在IJSEM上,此比对结果为IJSEM认可,俺的文章引用其数据已接受。
2.此网址16S比对结果比NCBI上的结果好的特点是,全部是模式菌株,而且更新很快。
可以将最近的种属关系显示出来,同源性,以及碱基差异个数等等结果。
3.此网址比对的结果,方便下载,极大便于做进化树等工作。
4.不好的地方:需要注册,识别IP,不过可以反复注册。

要想熟练掌握,熟读其IJSEM上的文章,或者自己琢磨吧!!本人只能抛砖引玉!

[ Last edited by charon1982 on 2009-10-9 at 16:51 ]

http://147.47.212.35:8080/已经不能用了,更新为下面的网址:
http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/

[ Last edited by charon1982 on 2014-3-19 at 10:25 ]
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

帮助虫友,提升自己
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

greenwoodzjl

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
赞!请教楼主一个问题 分离到一株芽孢杆菌  最高相似性只有95%   把extron比对中获得的相似性最高的78株菌做了进化树 用非芽孢杆菌属的细菌做外群 NJ法建树 逐渐减少距离新种远的菌株  最后减少到24株    比对后序列长度 1420bp     但是系统进化树中新种所在簇的自展值只有40%-50%  看了几篇新种鉴定文章发现新种所在簇的自展值都蛮高的   自展值低如何改进呢?你看有什么建议吗?多谢多谢!
34楼2014-04-26 01:55:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 36 个回答

wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
好东西啊,怎么没有评价,多谢楼主了
金币是赌出来的
4楼2009-06-09 09:18:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bioman9810

木虫 (著名写手)

千娇百媚是哥的妞儿


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
” 要想熟练掌握,熟读其IJSEM上的文章,或者自己琢磨吧!!本人只能抛砖引玉!“

楼主砖都抛的这么帅这么有型,我支持下!
头搭毛巾也掩盖不住哥耀眼的光芒,哥一直帅的很低调,仰角45°深深陶醉中....
8楼2009-06-09 10:49:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pph0259

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
赞一个!
10楼2009-06-11 10:58:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿华中科技大学,化学专业344分,求调剂 +3 邢xing1 2026-03-02 3/150 2026-03-02 17:32 by houyaoxu
[考研] 考研复试调剂,过国家线的同学都可报名 +4 黑!在干嘛 2026-02-28 5/250 2026-03-02 16:48 by chock1337
[考研] 材料化工调剂 +12 今夏不夏 2026-03-01 14/700 2026-03-02 16:09 by 今夏不夏
[考研] 303求调剂 +5 今夏不夏 2026-03-01 5/250 2026-03-02 15:01 by 向上的胖东
[考研] 0856调剂 +7 刘梦微 2026-02-28 7/350 2026-03-02 14:11 by liyongv
[考研] 272求调剂 +7 材紫有化 2026-02-28 7/350 2026-03-02 12:48 by 无际的草原
[考研] 材料工程274求调剂 +4 Lilithan 2026-03-01 4/200 2026-03-02 12:06 by yuchj
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +6 礼堂丁真258 2026-02-28 9/450 2026-03-02 12:04 by 52hz~~
[考研] 材料调剂 +6 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 7/350 2026-03-02 10:42 by Jy?
[考研] 材料类求调剂 +11 wana_kiko 2026-02-28 14/700 2026-03-02 08:46 by 聪明的大松鼠
[考研] 322求调剂 +3 熊境喆 2026-03-01 3/150 2026-03-02 08:44 by houyaoxu
[硕博家园] 博士自荐 +7 科研狗111 2026-02-26 11/550 2026-03-01 22:24 by 哲平L
[考研] 272求调剂 +6 田智友 2026-02-28 6/300 2026-03-01 21:40 by 公瑾逍遥
[考研] 306分材料调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:48 by 无际的草原
[考研] 课题组接收材料类调剂研究生 +3 gaoxiaoniuma 2026-02-28 4/200 2026-03-01 14:30 by jjj三跨
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +6 Soliloquy_Q 2026-02-28 11/550 2026-03-01 11:14 by 歌liekkas
[考研] 307求调剂 +4 73372112 2026-02-28 6/300 2026-03-01 00:04 by ll247
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
请填处理意见