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Liammo

铜虫 (初入文坛)

[求助] 如何确定某种细菌的耐性基因呢?已有2人参与

想研究一下大肠杆菌在脉冲电场环境下的基因表达变化情况。看了好多文献,大家的实验方法都是已知某种基因会变化的前提下,通过实验证实这种变化。不过我的实验打算从零做起,探究大肠杆菌在电场下具体哪个基因会发生变化。但是本人从来没有接触过基因实验,团队里面也没人做过,想问一下这种实验的设计思路是怎么样的呢?有没有什么文献或者参考书有提及这个方向的内容呢?
感谢大家!!
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z457634588

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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Liammo: 金币+5, ★★★很有帮助, 感谢! 2019-10-31 11:45:45
从零做起的话这会是一个比较大的实验,如果只是单独的想研究电场改变对基因表达的影响,可以分设对照组和实验组,再做一个转录组测序,即可立刻看到所有基因的相对表达量上调和下调,如果钱多还可以做绝对定量转录组测序。
2楼2019-10-30 16:45:58
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biosci

捐助贵宾 (职业作家)


3楼2019-10-30 21:10:27
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梦幻太初

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
大肠杆菌在脉冲电场环境下的基因表达变化,可以设定一个实验组和对照组,经过正常培养和在电场下培养,最后对大肠杆菌进行基因测序,可以比较两组大肠杆菌的基因变化。

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4楼2019-10-31 10:41:07
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Liammo

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 梦幻太初 at 2019-10-31 10:41:07
大肠杆菌在脉冲电场环境下的基因表达变化,可以设定一个实验组和对照组,经过正常培养和在电场下培养,最后对大肠杆菌进行基因测序,可以比较两组大肠杆菌的基因变化。

感谢!如果是对正常培养和电场培养两组大肠杆菌的全部基因测序,得到的数据量会不会非常庞大呢?一般来说,分析基因测序的数据结果需要花费多少时间呢?
5楼2019-10-31 11:48:48
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