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hsw201204

木虫 (小有名气)

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[求助] 二十肽的二级谱分析已有1人参与

各位虫友，最近我正在做二十肽的修饰，想用二级谱分析。使用的是waters的Q-TOF，分子量约为2000+，碰撞能30V，在该条件下，b+信息缺失很多，其中两条二十肽y+离子信息只有1-3个缺失，另一个y+缺失近一半。且y+中很多为带两个电荷或三个电荷的峰。我的三条二十肽区别仅仅是其中一个氨基酸位置不同，其余均一样。想请教各位群友，为什么b+信息缺失很多，是不是我哪里设置上存在问题。谢谢各位！

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1楼 2019-10-28 17:20:33

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S8032

银虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

not favorable for b ions for your peptide.
1) using different collision method, such as Electron Capture Dissociation, or Electron-transfer dissociation
2) derivatize your peptide

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