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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】请教集群下提交任务
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goalry

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请教集群下提交任务

我无论是在Windows下通过ssh登陆集群还是在linux下通过ssh登陆集群，在进行计算时，都不能退出ssh，否则运算会终止。
听说登陆集群后以提交任务的方式进行运算可以关掉终端的窗口，但我不知道提交任务是怎么回事，还请大家指教！！
请您以您自己的工作经验详细的说明一下这个过程，包括是否是用ssh登陆，登陆后怎么提交，怎么设置使用节点数，怎么查看运算进程。

谢谢谢谢！！
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君子以自强不息，厚德载物
1楼 2009-06-06 22:11:30
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):thank you very much! 6-7 18:43
zhaohscas1976(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-9 16:04
goalry(金币+3,VIP+0):恩，谢谢！！ 6-9 22:32
goalry(金币+1,VIP+0):谢谢 6-10 10:53
楼主用的集群有PBS吗？
有的话，写脚本提交就行了，具体脚本建议你看看PBS的UserGuide
没有的话，可能是用nohup命令交的后台作业
赞一下(19人) 回复此楼
2楼2009-06-07 13:50:34
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frank178

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
zeoliters(金币+1,VIP+0):谢谢回帖交流！ 6-7 12:11
zhaohscas1976(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-9 16:04
goalry(金币+1,VIP+0):谢谢啊！ 6-9 22:32
用nohup也不是很保险，我看楼主用的是mpich2吧，那就是mpd进程的问题咯，我也遇到过这样的问题，后来还是干脆转用mpich和openmpi了
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3楼2009-06-07 18:56:30
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zeoliters

木虫 (正式写手)
★ ★
zhaohscas1976(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-9 16:04
goalry(金币+1,VIP+0):感谢参与！ 6-10 10:54
nohup交后台作业与使用哪种mpi应该是没有关系的。
引用回帖:
Originally posted by frank178 at 2009-6-7 11:56:
用nohup也不是很保险，我看楼主用的是mpich2吧，那就是mpd进程的问题咯，我也遇到过这样的问题，后来还是干脆转用mpich和openmpi了

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4楼2009-06-07 19:13:27
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
★ ★ ★ ★ ★
zeoliters(金币+2,VIP+0):鼓励交流！ 6-7 13:55
zhaohscas1976(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-9 16:04
goalry(金币+1,VIP+0):谢谢 6-9 22:33
goalry(金币+1,VIP+0):感谢参与！ 6-10 10:54
引用回帖:
Originally posted by frank178 at 2009-6-7 18:56:
...我看楼主用的是mpich2吧...

这你也能看得出来啊
nohup跟哪种mpi确实没有关系，以前我就经常干这事
赞一下(13人) 回复此楼
5楼2009-06-07 19:35:26
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frank178

金虫 (正式写手)
★ ★
goalry(金币+2,VIP+0):感谢您的参与！ 6-10 10:54
其实主要还是mpich2没有装好，一个朋友他运行完全没有问题，而我却遇到和楼主一样的问题。 楼主可以仔细研究一下mpich2的安装。
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6楼2009-06-10 09:18:22
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fengya0785

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by xujc1983 at 2009-6-7 19:35:

这你也能看得出来啊
nohup跟哪种mpi确实没有关系，以前我就经常干这事

这楼说得对，我补充一下
nohup mpirun -machinefile xxx -np xx xxxx >out &
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E
7楼2009-06-10 16:34:49
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goalry

金虫 (正式写手)
谢谢大家，我的问题已经解决
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君子以自强不息，厚德载物
8楼2009-06-11 14:57:02
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dirtor

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
nohup很容易使用，但还是比较“简陋”的，对于简单的命令能够应付过来，对于复杂的需要人机交互的任务就麻烦了。

其实我们可以使用一个更为强大的实用程序screen
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2009-06-11 17:00:22
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