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新虫 (小有名气)

[交流] 混合菌驯化后高通量测序相关 已有2人参与

对从污水厂取来的污泥中的混合微生物进行培养驯化,通过添加特定污染物和无机盐进行曝气,一段时间后,进行高通量测序,发现other里面的比例接近50%,也没有一个突出的优势菌系出现。按理来说应该有一种占优势的菌出现。这是为什么呢?

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yanxing19

新虫 (正式写手)


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驯化了多久?目标污染物是否有检测?发生了降解没

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2楼2019-10-09 15:01:11
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693916432

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yanxing19 at 2019-10-09 15:01:11
驯化了多久?目标污染物是否有检测?发生了降解没

驯化了一个半月左右,没有检测污染物。

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3楼2019-10-09 15:13:10
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693916432

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yanxing19 at 2019-10-09 15:01:11
驯化了多久?目标污染物是否有检测?发生了降解没

驯化方式可能稍显粗糙,但是至少师兄师姐是可以驯化出优势菌种的,所以到我这里没有出来,我就有点奇怪。

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4楼2019-10-09 15:15:21
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yanxing19

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by 693916432 at 2019-10-09 15:15:21
驯化方式可能稍显粗糙,但是至少师兄师姐是可以驯化出优势菌种的,所以到我这里没有出来,我就有点奇怪。
...

把实验设计,具体的底物组成和具体什么污染物说一下?驯化的目的是使目标污染物有所降解,如果没有,也就没有所谓的优势菌?但是一般不同的底物都会对群落完成筛选。。

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5楼2019-10-09 15:52:12
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mooun

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,你好,我这边是公司,微生物这块我们目前开发出的绝对定量技术可以将16s ITS精度提高到种,如果您感兴趣我们可以交流下

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6楼2019-10-14 16:32:29
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