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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 蒙脱石分子模拟
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shuqi2019

新虫 (小有名气)

[交流] 蒙脱石分子模拟

各位在material studio 中几何优化蒙脱石结构，是否会出现结构从原来的两层结构夹中间一层水分子变成只剩一层结构，上面再一层水分子呢？请问这是什么原因啊?谢谢了！

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1楼 2019-09-23 10:36:48
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春迷雨蔓

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，想问问你的蒙脱石晶体结构是怎么建出来的，我在建立的时候有些问题

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2楼2019-09-23 11:12:35
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
描述问题缺少细节，别人无法回答你。
比如模型什么样，原始参考是什么，用的什么力场。最好图摆出来，之前是什么样，优化以后什么样。
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3楼2019-09-24 11:02:02
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shuqi2019

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 春迷雨蔓 at 2019-09-23 11:12:35
楼主，想问问你的蒙脱石晶体结构是怎么建出来的，我在建立的时候有些问题

我使用的是之前毕业的师兄留下的模型，我看网上有人说Goo gle蒙脱石的cif模型，导入M S，，还有人输入自己建，通过输入详细的各原子笛卡尔坐标，再手动连键。
但是我没试成功(哭

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4楼2019-09-25 23:24:38
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shuqi2019

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 赵红霞 at 2019-09-24 11:02:02
描述问题缺少细节，别人无法回答你。
比如模型什么样，原始参考是什么，用的什么力场。最好图摆出来，之前是什么样，优化以后什么样。

感谢您的提醒，我是钠蒙脱石吸附32个水分子，采用UFF力场在Forcite模块几何优化(geo-opt)，优化前后的图片见下

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5楼2019-09-26 13:17:45
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shuqi2019

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by shuqi2019 at 2019-09-26 13:17:45
感谢您的提醒，我是钠蒙脱石吸附32个水分子，采用UFF力场在Forcite模块几何优化(geo-opt)，优化前后的图片见下
...

不好意思，图片发送有问题

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6楼2019-09-26 13:19:36
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shuqi2019

新虫 (小有名气)
回来解决一下，按照我浅薄的理解是这是正常的，并没有缺失结构，看原子数就知道了。本来只建了一层，最开始的结构只是MS自身显示的原因

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7楼2020-04-23 21:52:09
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Di_vaNo

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我想咨询一下楼主。建蒙脱土晶体的时候，导入的晶胞没有氢原子，结构中的氢原子是自己手动添加的么？

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8楼2021-06-25 01:49:57
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槛外人01

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by Di_vaNo at 2021-06-25 01:49:57
我想咨询一下楼主。建蒙脱土晶体的时候，导入的晶胞没有氢原子，结构中的氢原子是自己手动添加的么？

自动加氢

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9楼2021-07-07 08:02:46
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