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吧啵face

新虫 (初入文坛)

[求助] NCBI确定序列中的起始密码子和终止密码子 已有1人参与

本人外行一个,求助各位大神帮帮忙,怎么用NCBI找出PRL基因序列的外显子个数,内含子剪切点还有起始密码子和终止密码子

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GRUBBY_WU

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
举个例子:查询human PRL这个基因,点下面那个链接(如果是别的物种,用ncbi的gene数据库找)
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/5617

1.外显子个数,页面搜索“Exon count”

2.真核内含子剪接位点都是符合GU-AG法则的,就是  外显子gu--------ag外显子gu------ag外显子   这种形式,gu-ag
就是剪接位点。

3.找起始/终止密码子,页面搜索“tools”,点击下拉菜单选“sequence text view”,里面的序列淡红色背景是外显子(下边对应了氨基酸序列,绿色背景是内含子),第一个密码子就是ATG(M)就是起始密码子,翻页(next page)最后一个密码子TAA(*)终止密码子
2019更好更棒!
2楼2019-09-23 12:26:25
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