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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 其他 » 【其他】征集本版成功求助贴
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mozhui

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Vasp&MedeA

【求助】VASP里面的费米能级表示什么？

OUTCAR里面有一个参数，用grep “fermi" OUTCAR可以得到，比如：

E-fermi :   1.0372     XC(G=0):  -6.7744     alpha+bet : -8.3695

求教：这个Fermi Energy表示的是
1.价带顶的位置 还是
2.Fermi-Dirac分布中占据能级的几率是1/2的位置？

谢谢～

3楼： 电子正好填充到该能量尚
4楼： 我觉得是前者吧
电子的最高占据轨道
6楼： 同意前者。
7楼： 电子正好填充到该能量尚
8楼： 0温下还有什么1/2占据？把T=0代近fermi-dirac公式，整个就一个阶跃函数好吧！自己看公式去。。

另外，9楼介绍了相互作用费米子的分布情况，赞一个，不过与本问题关系不大~
VASP总是取电子的最高占据态为费米能级，因而对于半导体，VASP所取的费米能级为价带顶，与通常的定义不同，这点要小心~
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41楼2009-06-04 15:29:01
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mozhui

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Vasp&MedeA

【求助】求助，CHGCAR的单位?
2楼：e/A3
3楼：这个问题，我自己已经搞定了。 应该是e／A3 在乘以fft的点数的。
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42楼2009-06-04 15:38:16
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mozhui

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Vasp&MedeA

【求助】求教如何画态密度图？

搜了一下，看到一般的步骤为：
第一步，就是对研究体系进行驰豫，得到稳定的结构和体积。
第二步，就是进行静态计算，获得电子密度等
第三步，非自恰计算获得DOSCAR

我已经对体系弛豫完毕。但是不知道第2、3步中INCAR里具体的那些参数需要调整。

2楼：
second step:
SYSTEM =XXX
PREC = Accurate
ISTART=0
ENCUT = 1000.0    ＃在作结构优化时，需要收敛测试。用那个就行。
EDIFF = 1e-5
ISMEAR =1          # 1 metal ; 0 non-metal
SIGMA = 0.2
LCHARG = T
LWAVE = T

POSCAR KPOINTS POTCAR 都用结构优化时的。POSCAR 用你想做的那个压力点的CONTCAR。
third step：
SYSTEM = XXX
PREC = Accurate
ISTART=1
ENCUT = 1000.0
EDIFF = 1e-5
ICHARG=11
ISMEAR=-5
SIGMA = 0.2
LORBIT=10    # 计算s p d 时用10 想算用px py 11。
第二步计算是在结构优化的结果上进行的，所以开始第二步的时候，将第一步中的输入文件INCAR, POTCAR, POSCAR, KPOINT 以及 C* 文件放入静态自洽计算中去，并且将CONTCAR 拷贝到 POSCAR中，然后运行VASP。计算结果中的Fermi能是准确的，需要记下。
得到的DOSCAR ， 就是你想要的了。
4楼：
1.结构优化，即普通计算
    2.将优化之后产生的CONTCAR文件改成POSCAR, 做静态计算.输入文件包括KPOINT,POTCAR,POSCAR,CHGCAR,INCAR;INCAR中ICHARG=2,ISTART=0,ISMEAR=-5,LCHARG = .TURE.;
    3.将静态计算产生的CHARGCAR文件拷贝到输入目录中,INCAR,POSCAR,POTCAR,KPOINTS和CHARGCAR, INCAR需做如下改动, ICHARG=11,ISMEAR=-5,LORBIT=11;并增加K点.
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43楼2009-06-04 15:45:02
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wuchenwf

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问题：

在不加U的时候静态计算30步左右收敛，但是考虑U，60步还不收敛
我能不能顺着现在的不收敛波函数继续往下叠代呢？该怎么做？
还是调整参数？求教各位了！

我的INCAR:

SYSTEM = LAYER
ISTART = 0
ICHARG = 2
ENCUT = 520
ISPIN = 2

EDIFF    = 1E-4
EDFIIG = -1E-2
ISMEAR   = 2
NPAR = 3
AMIX     = 0.2
BMIX     = 0.0001
AMIX_MAG = 0.8
BMIX_MAG = 0.0001
LREAL = .TRUE.

Dynamic:
#IBRION = 2
#NSW = 500
#POTIM = 0.2

LORBIT   = 11

LDAU      = .TRUE.
LDAUTYPE  = 2
LDAUL     = 2 -1 -1
LDAUU     = 3.00 0.00 0.00
LDAUJ     = 0.87 0.00 0.00
LDAUPRINT = 2

LMAXMIX   = 4          ! Important: mix paw occupancies up to L=4

9楼：我把阶段能降低至450eV ，EDFIIG放宽至-0.03，还是不起作用。
我再试试300eV看。。

14楼：问题解决！在INCAR里面加了3个参数！
NELM=200   #指定最大电子步数
NELMDL=8   #指定开始计算时非自洽迭代步数，计算8步以后产生的波函数再用于下面的自洽计算
WEIMIN=0   #这个不清楚，不知道什么意思？有谁知道呢？告诉我吧
不知道我对参数的理解对不对，还请各位指教！
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44楼2009-06-04 21:16:39
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mozhui

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Vasp&MedeA

【求助】一个VASP安装文件有多大？

弱弱地问一下！
一个vasp安装盘中的文件有多大？
2楼：弱弱的说一下,安装文件不到1.5M
4楼：加上势文件不超过100M
5楼：人家卖给你的是源代码，可不是打包好的商业软件。虽然只有1.5M，但软件售价又不是和文件大小相关的。再说VASP售价也算厚道了
6楼：还是1.5M
9楼：势函数是单独下载的.
安装文件就1.5M
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45楼2009-06-04 21:46:55
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mozhui

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Vasp&MedeA

求助】关于VASP测试的命令输入

例如在做截断能测试时 写好脚本 按照下面提示在终端输入命令
==================
（二）计算任务执行方法：
输入：dos2unix optencut.sh
bash optencut.sh
==================
结果就出错了
没办法继续算下去

这是为什么呢？？？那该怎么写入呢？？？
对FeISMEAR能设置成-5吗？

问题脚本：
========================
（一）输入文件：
1、用脚本程序optencut.sh代替INCAR文件：
rm WAVECAR
for i in 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 600
do
cat > INCAR < SYSTEM = bcc Fe
ENCUT = $i
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = -5
PREC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i eV"; time vasp
E=$(grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1| awk '{printf "%12.6f \n", $5}')
echo $i $E >> comment
done
===========================

6楼：要将 optencut.sh 文件属性改为可执行文件，用命令：  chmod +x optencut.sh

下一步输入命令：  ./optencut.sh   就可以运行了.
8楼：金属的话一般用１和２　但做静态计算的时候设成-５
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46楼2009-06-04 21:52:03
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mozhui

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Vasp&MedeA

【讨论】paw势过于陈旧，会导致计算会出现错误么？
现在我使用的paw势都是98年到01年的。尤其是用的比较多的O 的paw-GGA。结果计算的体系在自洽过程中，很难收敛。已经调整过mixing的方法等促进收敛的方法。依然没有作用。后来按照手册上测试单原子的赝势，发现能量在几百毫电子伏，与期望的1~10m eV有很大出入、
请问大家用的paw势都是哪一年出版的呢？有没有遇到过同样的问题

2楼：VASP里面都是01年造的吧，我觉得和时间关系不大，都是成熟的理论，赝势主要靠测试，如果不行就换吧，
3楼：我觉得，老的、很多人用过的，才更保险啊。除非你用的是很早就造出来但从来没有人用过的。
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47楼2009-06-04 21:57:08
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mozhui

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Vasp&MedeA

【求助】谁知道新版VASP5.2的价钱？
2楼：1000欧元从4.6升级。全新购买4000欧元
3楼：一个licence，升级1000；
两个licence，升级2000.
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48楼2009-06-04 22:00:01
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mozhui

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wuli8(金币+2,VIP+0):感谢 6-5 20:49
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Vasp&MedeA

【求助】VASP中的赝势

问个小问题：VASP中的ultrasoft pseudopotential 中有没有PBE型的？

2楼：没有，PBE是paw型的
3楼：没有
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49楼2009-06-04 22:01:51
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mozhui

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Vasp&MedeA

【求助】VASP并行不了了，望大家帮助！

VASP的并行版本计算，交换机重启了一下，开机后发现所有结点都挂上去了，但是运行VASP作计算时出错，出错信息如下：

Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
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rank 6 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 6: killed by signal 9
rank 5 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 5: return code 0
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
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rank 4 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 4: return code 0
rank 15 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
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rank 13 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
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rank 12 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
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rank 19 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
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rank 18 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 18: return code 0
rank 17 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
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rank 16 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
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rank 0 in job 8  node01_33013   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 0: return code 0


该如何设置解决？（本人对集群并行什么的知之甚少，望大家把办法说得详细点，谢谢！）


2楼：idear::
可能是网络文件系统如nfs出错，某些节点不能访问INCAR所在文件系统
4楼：
只能一个一个的查。

先看看你设定计算的节点中有哪个是不能远程登录的。然后看看不能登录的原因是什么；

如果节点可以登录，在通过节点登录nfs中的任意一个文件，如果不能读取，说明nfs加载有问题，有需要要重新挂在nfs。


NFS卷的加载方法与普通文件系统的加载方式是一样的。使用下面的句法调用mount：
# mount –t nfs nfs_volume local_dir options
nfs_volume是以remote_host:remote_dir形式给出。由于这个表示法对NFS文件系统来说是唯一的，你可以省略-t nfs选项。

在加载一个NFS卷时，你可以指定许多别的选项。这些选项可以在命令行上在-o开关后面给出，或者在/etc/fstab该卷条目的选项字段内给出。在这两种情况下，多个选项是用逗号彼此分开的。在命令行上的选项总是覆盖fstab文件中给出的选项。

nfs也是在每次启动的时候自动加载的。在/etc/fstab中的一个样本条目可以是
# volume         mount point     type options

news:/usr/spool/news /usr/spool/news   nfs   timeo=14,intr
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50楼2009-06-04 22:04:37
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