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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 其他 » 【其他】征集本版成功求助贴
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wuli8

荣誉版主 (知名作家)

…………

优秀版主优秀版主

[交流] 【其他】征集本版成功求助贴

【活动目的】
经常光临“第一性原理版”的虫子都很清楚，本版是以求助贴为主的。有的求助贴，求助成功了，但是有的没有。这样就很混乱，时常有2次求助的现象发生。这样很不利于大家交流。为了解决这一问题特向各位征集本版成功求助贴。
【跟帖方式】
[求助贴链接]（必填项）
[求助的问题]（必填项）
[求助问题的归类]（必填项）
[问题的正确答案]（必填项）
[你认为正确的答案]（可选项）
【注意事项】
1、发帖前请查看有没有别人已经发过您的内容，重复贴无效。
2、问题的答案要正确无误，如果原帖没有正确答案，你可以进行补充。明显错误的答案，为无效贴。
【相关奖励】
每一个有效的征集奖励5个金币，特别优秀者奖励Vip0.1个。



PS:帖子前缀为【求助成功】的表示别人已经在此处发过帖子，请不要重复发帖。谢谢大家的参与！

[ Last edited by wuli8 on 2009-6-25 at 17:24 ]
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…………
1楼2009-06-02 10:04:47
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zhangyunli

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuli8(金币+5,VIP+0):感谢参与，(*^__^*) 嘻嘻…… 6-2 18:05
[求助贴链接]（必填项）
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1314921&fpage=17
[求助的问题]（必填项）【求助】编译mpich出错！

各位牛人，我是初学者，编译vasp单机并行版，用的是ifort，mpich-1.2.5.2，ifort已经编好了，但在编mpich时出现问题，我的步骤是：在mpich-1.2.5.2下
a）./configure  b)make  c)到root用户下make install，这时出现问题：
[root@powerleader2 mpich-1.2.5.2]# make install
if [ "" = "" ] ; then \
            ./bin/mpiinstall  ; \
        else \
            ./bin/mpiinstall -prefix=  ; \
        fi
cp: `/home/fyu/mpich-1.2.5.2/bin/tarch' and `/home/fyu/mpich-1.2.5.2/bin/tarch' are the same file
**Error copying file /home/fyu/mpich-1.2.5.2/bin/tarch to /home/fyu/mpich-1.2.5.2/bin/tarch **
make: *** [install] Error 1
请问是什么问题，谢谢您的解答，对我很重要！

[求助问题的归类]（必填项）MPI编译
[问题的正确答案]（必填项）2楼：
建议重新 configure一下设置好安装目录
export FC=ifort
export F77=ifort
export CC=icc
export CXX=icc (?写错了没有有点忘记了，自己看帮助)
如果没有intel 的C/C++编译器就省三四行。
./configure --prefix=/ 填写目录
然后再make
make install
3楼：
cp: `/home/fyu/mpich-1.2.5.2/bin/tarch' and `/home/fyu/mpich-1.2.5.2/bin/tarch' are the same file

你看一下这个出错说明
5楼：谢谢你的回答，这个问题已经解决了，也没发现时什么问题，又重新安装了一遍就过去了，现在有个另外的问题，在最后测试mpi时，过不去
[root@powerleader2 basic]# make cpi
/home/fyu/mpich-1.2.5.2/bin/mpicc   -c cpi.c
/home/fyu/mpich-1.2.5.2/bin/mpicc  -o cpi cpi.o -lm
[root@powerleader2 basic]# cd /home/fyu/mpich-1.2.5.2/bin/
[root@powerleader2 bin]# mpirun -np 4 cpi
mpdrun_powerleader2: cannot connect to local mpd (/tmp/mpd2.console_root); possible causes:
  1. no mpd is running on this host
  2. an mpd is running but was started without a "console" (-n option)
请问是怎么回事？
6楼：运行”mpd &“就好了
打开mpd来管理并行任务，这个是mpich的默认管理程序。
7楼：需要先在自己主目录下写一个.mpd.conf
内容：

secretword=mr45-j9z

然后设置文件属性
chmod 600 .mpd.conf

然后再照LS说的
nohup mpd&

mpirun -np N XXX

[你认为正确的答案]（可选项）

[ Last edited by zhangyunli on 2009-6-2 at 17:54 ]
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31楼2009-06-02 17:53:04
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wuli8

荣誉版主 (知名作家)

…………

优秀版主优秀版主
例如：

[求助贴链接]（必填项）http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1353588&fpage=3
[求助问题的归类]（必填项）MS问题
[求助的问题]（必填项）我的MS图形不能旋转也无法选中请问该怎么办，和什么软件冲突吗，十分 感谢，太着急了，没有这个功能啥也干不了！
[问题的正确答案]（必填项）2楼：一般是和QQ冲突了，你开了QQ吗？计算的时候，尽量不开没有用的软件，要专心啊！
3楼：和QQ冲突的可能性很大，重启就好了！
8楼：实在不行就重装，我每次都是重装就好了
9楼：估计是内存不够了，关一些不用的程序。
[你认为正确的答案]（可选项）

[ Last edited by wuli8 on 2009-6-2 at 15:52 ]
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…………
2楼2009-06-02 10:04:52
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wuli8

荣誉版主 (知名作家)

…………

优秀版主优秀版主
备用

[ Last edited by wuli8 on 2009-6-2 at 10:12 ]
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…………
3楼2009-06-02 10:04:56
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liuxiaocunde

铁杆木虫 (著名写手)

古德里安将军
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuli8(金币+5,VIP+0):谢谢参与，这个答案好像不全，(*^__^*) 嘻嘻…… 6-2 15:39
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1329553&fpage=6

MS

求助，请问哪位高手算过Ir的单个原子能量呢?怎么用CASTEP总是算不出来呢？有什么秘诀么？

单个原子？
你就建一个10X10埃的格子，放一个原子在里面，然后做能量计算就好了。
可以不要优化，直接能量计算……
不需要优化，直接算能量就好了，vasp也可以
注意 一下 kpoints的设置（在这种计算时，K点要选择伽马点，因为，对于原子或是分子，其他的K点是没有意义的，它们不是周期性结构）

[ Last edited by liuxiaocunde on 2009-6-2 at 17:18 ]
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新征途
8楼2009-06-02 15:19:00
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