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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】求助,grid spacing设置的是什么？
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】求助,grid spacing设置的是什么？

看到许多软件里设置都有grid spacing这个选项，字面意思是格子距离，MD里每个格子不都是紧密排列的吗？何来grid spacing这个概念呢？
有没有知道的虫虫给解释下呢？谢谢

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 20:02 ]
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1楼 2009-05-31 21:06:15
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xuefei06

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
erylingjet(金币+2,VIP+0):感谢交流 6-8 17:47
grid spacing 一般是指反空间的格子大小，MD计算涉及到计算速度的问题，有些积分在正空间就可以很快算出，有些则需要在反空间计算才更快，这是通常用到傅里叶变换，  就涉及到了反空间格子大小划分的问题了。
  另外，DPD是一种是一种粗粒化的模型，通常情况下不用计算静电相互作用，但如果某些基团极性很强或者带很多净电荷的话，那么也应该加上静电力这一项。
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6楼2009-06-08 17:17:18
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armeria

铁虫 (初入文坛)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 6-6 08:15
Particle mesh Ewald算法里有对傅立叶空间的截断，对应的就是实空间有格子的划分，以计算长程静电相互作用。
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3楼2009-06-06 02:07:43
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by armeria at 2009-6-6 02:07:
Particle mesh Ewald算法里有对傅立叶空间的截断，对应的就是实空间有格子的划分，以计算长程静电相互作用。

你说的好像有点问题饿，我这个是在DPD里见到的，DPD不用计算静电作用力，但是也有这个选项
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4楼2009-06-06 10:23:18
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armeria

铁虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎参加讨论 6-8 07:52
引用回帖:
Originally posted by qzhaosdu at 2009-6-6 10:23:

你说的好像有点问题饿，我这个是在DPD里见到的，DPD不用计算静电作用力，但是也有这个选项

对不起，我以为您是要问Gromacs相关的问题，不知道您是要问Dissipative particle dynamics相关的问题。我没有用过DPD，只是看别人用过，请问您为什么DPD不用计算静电作用力呢？我觉得应该算啊。谢谢。
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5楼2009-06-08 02:52:56
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