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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS中石墨烯氢化问题
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shanks2017

铁虫 (小有名气)

[求助] MS中石墨烯氢化问题

将已建立的石墨烯模型导入MS中，想对模型中特定原子进行氢化，怎么实现啊？各位帮帮忙啊。
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1楼 2019-08-17 10:14:46
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烤盐君

禁虫 (小有名气)
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shanks2017
2楼2019-08-17 10:34:34
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shanks2017

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 烤盐君 at 2019-08-17 10:34:34
点击你想加氢的原子后，点击H的图标就行

谢谢你的回复，那键长和键角就是对应的准确的C H的吗？还需要修改吗？
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3楼2019-08-17 10:55:56
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echo1994

禁虫 (知名作家)
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shanks2017
4楼2019-08-17 11:39:22
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shanks2017

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by echo1994 at 2019-08-17 11:39:22
结构优化啊
...

怎么结构优化啊，能不能说的详细点？而且我按你说的操作在边界上会出现一个碳原子上加了两个氢原子的情况，这个又是怎么回事啊？
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5楼2019-08-17 12:03:55
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shanks2017

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 烤盐君 at 2019-08-17 10:34:34
点击你想加氢的原子后，点击H的图标就行

而且我按你说的操作在边界上会出现一个碳原子上加了两个氢原子的情况，这个又是怎么回事啊？
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6楼2019-08-17 12:05:45
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shanks2017

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by echo1994 at 2019-08-17 11:39:22
结构优化啊
...

上面发错了不好意思
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7楼2019-08-17 12:06:47
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烤盐君

禁虫 (小有名气)
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shanks2017
8楼2019-08-17 13:36:49
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shanks2017

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by 烤盐君 at 2019-08-17 13:36:49
你取消自动加氢，自动的话可能补全游离的配位电子，所以加个2个氢，取消后，你想加多少个都可以，你说的键角和键长通过计算来优化
...

同学你好，怎样取消自动加氢按钮啊，我找了半天也没有找到这个功能，能不能跟我说一下，谢啦。
键长和键角是在MS中计算优化还是在LAMMPS in 文件中通过计算结构优化来实现呢？
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9楼2019-08-17 16:20:16
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