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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】linux下gaussian输入文件问题
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zzhenry

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】linux下gaussian输入文件问题

之前是在win平台上计算，刚好不容易在linux上装好了gaussian。昨天做了个输入文件，运行都成功了。今天在做时就出错了。
运行过程：在win下用gv建立输入文件，导入linux下，输入命令dos2unix，转换文件，然后计算运行。

而今天在进行格式转换的时候就好像出错了。
[zhouzhou@localhost g03]$ dos2unix kjt423.gif
dos2unix: converting file kjt423.gif to UNIX format ...
dos2unix: problems converting file kjt423.gif
几个输入文件都试了。都是“problems converting ”。不会是输入文件的问题，昨天同样的输入文件都可以运行。

接着试着运算一下，然后显示如下：
[zhouzhou@localhost g03]$ g03 kjt423.gif

Unable to open input file "kjt423.gif".

forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred

Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    00000039BAE0DD40  Unknown               Unknown  Unknown

libc.so.6          00000039BA230497  Unknown               Unknown  Unknown

g03                0000000000407099  Unknown               Unknown  Unknown

g03                0000000000405055  Unknown               Unknown  Unknown

g03                0000000000404C02  Unknown               Unknown  Unknown

libc.so.6          00000039BA21D8A4  Unknown               Unknown  Unknown

g03                0000000000404B29  Unknown               Unknown  Unknown


问题在哪，也许不是什么问题，但确实不懂，问问大家。
为什么转换格式都会失败了？大家都是怎么在linux建立输入文件的。

[ Last edited by zzhenry on 2009-5-31 at 18:40 ]
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1楼 2009-05-31 18:38:00
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hairan

木虫 (著名写手)

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gwdavid(金币+5,VIP+0):3q 6-9 09:20
引用回帖:
Originally posted by 皓儿165 at 2009-6-8 16:14:
，我一直都是直接连接到linux系统下，再将复制过来的win下的输入文件进行修改，你们说的那个文件转换是怎么回事啊？我的那种操作太笨了

我开始也是在windows下创建好输入文件，然后再用工具软件导入linux下，然后dos2unix，然后才能提交计算。
后来发现，用GaussView制作输入文件的时候，如果选择edit而不是submit，GaussView会调用文本编辑器把输入文件打开让你看看并修改，此时，在linux下直接用vi命令创建输入文件，然后把windows下的内容复制过去，然后保存就可以提交了，省下了从windows向linux传输和linux下格式转换两个步骤，能节省大量的时间。
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
18楼2009-06-08 21:46:28
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-31 19:02
扩展名gjf是windows下的输入文件名, 而linux下文件的扩展名应是com.
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愿好运与快乐伴随你！
2楼2009-05-31 18:52:36
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zzhenry

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by quantumor at 2009-5-31 18:52:
扩展名gjf是windows下的输入文件名, 而linux下文件的扩展名应是com.

是这样吗？我看gaussian讲座的ppt上讲也是用fttp上传windows下的gif文件，然后dos2unix 啊 安装linux下的gaussian软件的帖子也这么说的。？？
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3楼2009-05-31 19:42:58
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shalene

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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-1 09:09
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎参加讨论 6-8 12:44
不是gif，是gjf
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4楼2009-05-31 23:13:34
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pllyf2006

金虫 (著名写手)
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哇塞，gif，gjf这个太隐蔽了啊
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5楼2009-06-01 16:23:04
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suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫
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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-1 21:32
试试修改一下你的权限！
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做中国人的化学！！！！
6楼2009-06-01 17:42:23
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zzhenry

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by shalene at 2009-5-31 23:13:
不是gif，是gjf

哈哈，看来是我粗心了！
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7楼2009-06-01 20:04:28
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poppyly

铁虫 (小有名气)
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引用回帖:
Originally posted by shalene at 2009-5-31 23:13:
不是gif，是gjf

赞的，我都没看清
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8楼2009-06-04 16:20:08
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
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lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 经验之谈 6-4 20:03
引用回帖:
Originally posted by zzhenry at 2009-6-1 20:04:

哈哈，看来是我粗心了！

在linux下应该养成用[Tab]键补全文件名的习惯
如果lz敲上两三个字母后用[Tab]键补全，绝对不会出现这个问题
我一般敲一个字母就开始按[Tab]
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
9楼2009-06-04 16:55:51
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-5 19:56
gif---gjf……我一直觉得gjf的意思就是GaussianInputtingFiles，会不会是因为gif这个缩写已经被占，所以被迫后移一个字母成了gjf？
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10楼2009-06-05 13:15:19
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