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magnolia_xu

金虫 (正式写手)

[求助] MS计算优化晶体结构,slab模型计算请教! 已有2人参与

各位大神,有几个问题已经困扰我好几天了,请教一下!
1.        从structure文件导入的晶体结构,比如Cu.msi,导入之后算能量是否需要进行geometry optimization?我优化的时候发现,不同的cut-off 和k-point值,优化后晶格常数不一样,差别还挺大。
2.        建表面要cleave晶体结构,这个晶体是导入的Cu.msi,要切110面,需要先优化一下吗?
3.        优化几何结构,判断是否成功,就是看两次final enthalpy 的数值小于1mev吗?
4.        优化成功时用的cut-off和k-point,我在后面计算slab模型能量的时候是要继续用吗?还是要重新设置,根据出现的4个YES来判断?
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magnolia_xu

金虫 (正式写手)

自己顶一下。第一个问题已经解决了。任何时候都要先进行结构优化,导入的体相晶胞结构,优化的时候可以 optimize cell选项不勾掉,这样晶格参数就不会发生改变。
2楼2019-08-16 12:54:51
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ball2006

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
magnolia_xu: 金币+5, 有帮助 2019-08-18 21:58:03
2.  建表面要cleave晶体结构,这个晶体是导入的Cu.msi,要切110面,需要先优化一下吗?
答:需要优化。通过这一步优化得到的那个Final energy就是体能量Ebulk

3.  优化几何结构,判断是否成功,就是看两次final enthalpy 的数值小于1mev吗?
答:个人感觉是出现的4个YES来判断。

4. 优化成功时用的cut-off和k-point,我在后面计算slab模型能量的时候是要继续用吗?还是要重新设置,根据出现的4个YES来判断?
答:个人感觉可以继续用。
3楼2019-08-16 19:44:58
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magnolia_xu

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ball2006 at 2019-08-16 19:44:58
2.  建表面要cleave晶体结构,这个晶体是导入的Cu.msi,要切110面,需要先优化一下吗?
答:需要优化。通过这一步优化得到的那个Final energy就是体能量Ebulk

3.  优化几何结构,判断是否成功,就是看两次final ...

谢谢回复。已经搞定怎么算表面能啦。跟文献的差距很小了:)谢谢应助!
4楼2019-08-18 21:59:49
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jinxin1991

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

楼主能加个好友吗,我计算slab的能量时与文献差距有点大,不知道怎么弄
5楼2019-10-30 10:07:54
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douliguang

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by magnolia_xu at 2019-08-16 12:54:51
自己顶一下。第一个问题已经解决了。任何时候都要先进行结构优化,导入的体相晶胞结构,优化的时候可以 optimize cell选项不勾掉,这样晶格参数就不会发生改变。

晶格参数改变是正常的吧  我都选上
6楼2019-10-30 22:13:06
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西风youare

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by magnolia_xu at 2019-08-16 12:54:51
自己顶一下。第一个问题已经解决了。任何时候都要先进行结构优化,导入的体相晶胞结构,优化的时候可以 optimize cell选项不勾掉,这样晶格参数就不会发生改变。

不选上优化晶胞不就相当于没优化?

发自小木虫Android客户端
7楼2020-01-11 19:21:23
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