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wutingting5283

铜虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】ATK如何运行

求救各位虫子们：ATK中的脚码，从构型到各种参数的设置。要怎样在VNL可视化界面里运行呢？问题没啥水平，希望热心的虫子们给予解决。
三个金币做感谢！

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1楼 2009-05-31 15:27:46

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛

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性别: GG
专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
管辖: 计算模拟区务

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuli8(金币+1,VIP+0):感谢交流，(*^__^*) …… 6-1 20:38

在ATk说明书LI-H2-LI TWO-PROBE SYSTEM章节有，你自己仿照文中怎么算I-V曲线的下面的脚本修改自己的脚本应该可以得到。

# Restore initial density from old calculation
scf = restoreSelfConsistentCalculation("lih2li-scf.nc"

print '# Bias (Volt)\tCurrent (Ampere)'
# Run bias from 0.0 and 1.0 in steps of 0.1
for voltage in numpy.arange(0.0, 1.01, 0.1):
dft_method = TwoProbeMethod(
electrode_parameters=(electrode_params,electrode_params),
basis_set_parameters = basis_set_params,
iteration_control_parameters = iteration_control_params,
electrode_voltages = (voltage/2.0, -voltage/2.0)*Volt
)
# Store each calculation in a separate NetCDF file
ATK.setCheckpointFilename ('lih2li-bias-%.1f.nc' % voltage)
scf = executeSelfConsistentCalculation(
atomic_configuration=lih2li,
method = dft_method,
initial_calculation = scf
)
current = calculateCurrent(scf)
print "%.1f\t\t%.2e" %(voltage, current.inUnitsOf(Ampere))