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还重名啊

铜虫 (小有名气)

[交流] 怎么从NCBI下载别人的转录组使用 已有4人参与

怎么从NCBI下载别人的转录组使用
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匿名

用户注销 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖仅楼主可见
2楼2019-08-13 23:39:27
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GRUBBY_WU

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-08-17 16:21:54
从NCBI中的SRA(Sequence Read Archive)中下载,这个数据库主要储存高通量测序数据,包括二代和三代的各种平台所产生的数据。一般文献里涉及的高通量测序数据都会注明上传到了那个数据出,可以从哪里下载,仔细看看文章。
2019更好更棒!
3楼2019-08-14 08:32:20
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还重名啊

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by GRUBBY_WU at 2019-08-14 08:32:20
从NCBI中的SRA(Sequence Read Archive)中下载,这个数据库主要储存高通量测序数据,包括二代和三代的各种平台所产生的数据。一般文献里涉及的高通量测序数据都会注明上传到了那个数据出,可以从哪里下载,仔细看看文 ...

谢谢 下载后如何打开啊
4楼2019-08-16 15:14:12
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by 青蛙快飞 at 2019-08-13 23:39:27
下别人的序列就可以用了,例如用来做pcr引物设计的模板

下载的原始序列,有注释吗?如何设计引物?
5楼2020-04-24 21:51:17
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by GRUBBY_WU at 2019-08-14 08:32:20
从NCBI中的SRA(Sequence Read Archive)中下载,这个数据库主要储存高通量测序数据,包括二代和三代的各种平台所产生的数据。一般文献里涉及的高通量测序数据都会注明上传到了那个数据出,可以从哪里下载,仔细看看文 ...

你好,下载的序列有注释吗?还是要按照文献上的方法走一遍,重新注释吗?
6楼2020-04-24 21:52:00
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江江江浪才尽

捐助贵宾 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
sra转fq就行,prefetch

发自小木虫IOS客户端
7楼2020-05-02 07:47:46
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