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wangyibo20金虫 (小有名气)
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[交流]
【求助】grmocs拉伸动力学
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问一下如何确定拉伸方向？将配体从蛋白中拉出，是最初的确定方向，不是指调整方向。多谢大家了 在线等 |
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wangyibo20
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3楼2009-05-31 12:28:33
yalefield
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对拉伸分子动力学模拟中拉伸方向优化的方法及装置
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gwdavid(金币+4,VIP+0):老汉又来指导啦 5-31 11:50
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申请号/专利号： 200810035890 本发明提供一种通过对拉伸分子动力学中拉伸方向进行优化的方法，对我们分析配体与受体间的相互作用、配体诱导蛋白质的构象变化、配体和受体的选择性结合与最优结合路径的判定，都提供了支持。 首先，初始选取的拉伸方向做判断，只有当拉力达到一定的阈值时，开始对方向进行优化； 然后，根据基于信息熵的多种群遗传算法，对拉伸方向在三维空间内进行搜索和优化，得到新的优化后的拉伸方向； 最后，循环前面两个步骤，直至拉伸模拟结束。 通过对拉伸方向的优化，在拉伸分子动力学模拟过程中搜索合理的拉伸方向，改善传统拉伸分子动力学模拟过程中拉伸方向单一不变的模式，寻找更加合适的路径和方式。 申请日： 2008年04月10日 公开日： 2008年08月27日 授权公告日： 申请人/专利权人： 中国科学院上海药物研究所;大连理工大学 申请人地址： 上海市浦东张江祖冲之路555号 发明设计人： 蒋华良;王希诚;刘信力 专利代理机构： 北京金信联合知识产权代理有限公司 代理人： 朱梅 徐志明 专利类型： 发明专利 分类号： G06F17/50;G06F19/00;G06N3/12 |
2楼2009-05-31 11:31:15
yalefield
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4楼2009-05-31 12:45:14
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5楼2009-05-31 13:03:46