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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】集群中CASTEP无法算dos
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lightwlj

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】集群中CASTEP无法算dos

我在集群上运行CASTEP软件，但是总是结构优化完之后，不能继续算DOS等结构属性。不优化直接算DOS等属性也不能完成，原因不明，望各位高手指教。真诚谢谢。

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-20 at 12:20 ]
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1楼 2009-05-31 09:27:49
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TYHB

捐助贵宾 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请问楼主，能介绍些你是如何建立MS集群的么？小弟正想也建立个集群用来算MS，可否传授下经验？
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2楼2009-05-31 20:48:38
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study163

木虫 (正式写手)

天生我材
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuli8(金币+1,VIP+0):感谢交流，(*^__^*) …… 6-1 20:13
这个是由于 你单机上送作业 的MS版本与服务器上不一致造成的
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我的计算我做主
3楼2009-06-01 09:51:11
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lightwlj

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by study163 at 2009-6-1 09:51:
这个是由于 你单机上送作业 的MS版本与服务器上不一致造成的

谢谢你的回答，但版本是一致的，除了这个原因还有其他原因吗？
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4楼2009-06-02 07:42:06
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yulifto

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
版本不一致也没有关系，照样可以算啊，几何优化的时候，勾上态密度，分析选项，对应下面得pdos也勾上，应该可以算，我就是用集群算的 ！
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学而思！！！
5楼2009-06-02 07:50:12
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lightwlj

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yulifto at 2009-6-2 07:50:
版本不一致也没有关系，照样可以算啊，几何优化的时候，勾上态密度，分析选项，对应下面得pdos也勾上，应该可以算，我就是用集群算的 ！

是的，集群可以算，照你的设置，但我的是算不了，原因不明，总是在算到态密度时，出现以下错误：
Writing analysis data to Al_111_fccbridgehcp.castep_bin
Initialisation time =      4.79 s
Calculation time    = 250381.43 s
Finalisation time   =      2.05 s
Total time          = 250388.27 s
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...

所以很烦恼，还请高手指教
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6楼2009-06-02 20:44:54
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fuzp

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
qasd(金币+2,VIP+0):谢谢~ 6-3 22:03
你给出的信息太模糊，把这些东西前面的信息也贴出来。
你用什么泛函和交换关联？你的机子内存足够吧。

我用Sx-LDA+U的时候也经常碰到这个问题，系统优化的时候
很正常，但是算性质的时候，系统会有非常多的线程(8cpu的
机子出现50个线程)，内存也狂耗，机子失去响应。然后有相
应的时候，任务就出错了。对我的问题，感觉这是个bug。
单机和集群上都是这样。
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7楼2009-06-02 23:35:49
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lightwlj

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by fuzp at 2009-6-2 23:35:
你给出的信息太模糊，把这些东西前面的信息也贴出来。
你用什么泛函和交换关联？你的机子内存足够吧。

我用Sx-LDA+U的时候也经常碰到这个问题，系统优化的时候
很正常，但是算性质的时候，系统会有非常多的线 ...

感觉不是内存的问题，我计算的体系很小，需要内存不多，内存足够，就是算不下去，单独进行属性计算时，说文件名不对，比如属性文件为si_DOS.param，我写文件名为”si“，这没有问题呀，就是不行，改成”si_DOS“也不行，这是没有办法，不知道那里出了问题了。还请指教！谢谢
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8楼2009-06-03 08:05:17
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fuzp

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 6-5 20:31
我的体系只有4个原子，而机子是24G/8cpu，都出现我说的那种问题。
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9楼2009-06-03 10:02:33
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lightgjx

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by fuzp at 2009-6-3 10:02:
我的体系只有4个原子，而机子是24G/8cpu，都出现我说的那种问题。

问题是我的体系在单机上运行起来没问题。
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10楼2009-06-04 07:43:33
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