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chinaefulle

银虫 (小有名气)

[求助] 求助生物信息学文件:Fastq转Fasta 已有1人参与

我是一个生物信息方面的菜鸟。最近收到了测序数据,格式是Fastq,上网比对结果要求格式是Fasta。不知道如何将Fastq文件转化为Fasta文件。最好能推荐一款Windows环境下能用的软件。年级大了,Linux也不会玩。希望同行拉我一把。
云南中医药大学,段为钢
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西里夫
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

★ ★ ★
myprayer: 金币+3, 赠人玫瑰,手有余香,鼓励积极发帖交流互帮互助。 2019-09-23 20:42:33
你能复制序列吗?
其实FASTA就是下列各式:
>XXYY
ATGCCA...
2楼2019-08-08 17:38:27
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匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
3楼2019-08-11 22:15:52
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chinaefulle

银虫 (小有名气)

找到转化软件了,DOS程序seqkit,不错。
西里夫
4楼2019-09-06 15:59:43
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komjinhubuio

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
myprayer: 金币+3, 赠人玫瑰,手有余香,鼓励积极发帖交流互帮互助。 2019-09-23 20:43:00
用Popart吧,有集成Network和NCS的分析方法,关键不用钱。
5楼2019-09-23 09:47:48
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komjinhubuio

铜虫 (初入文坛)

回复错帖子,不好意思
6楼2019-09-23 15:00:43
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小呆呆33

新虫 (小有名气)

请问你知道咋把FAST文件转化成EXCEL格式呐,不然的话我要一个个复制黏贴太麻烦了

发自小木虫Android客户端
7楼2019-10-22 11:35:41
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