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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » ITS序列比对最高60%怎么办
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头秃的兔兔

新虫 (初入文坛)

[求助] ITS序列比对最高60%怎么办

超级小白。分离出一株病原菌(真菌)，测的ITS 然后比对的最高结果是60%，求问下一步该怎么做。测18s么还是怎样？
求大神指点 谢谢

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1楼 2019-08-05 21:08:39
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zg1415

金虫 (正式写手)
再测28s和18s

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一直被模仿，从未被超越
2楼2019-08-05 22:56:32
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头秃的兔兔

新虫 (初入文坛)
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2楼: Originally posted by zg1415 at 2019-08-05 22:56:32
再测28s和18s

两个都要测吗？还是可以只测一个

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3楼2019-08-06 21:20:12
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zg1415

金虫 (正式写手)
要是菌很重要，就都测吧

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一直被模仿，从未被超越
4楼2019-08-06 22:20:04
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头秃的兔兔

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zg1415 at 2019-08-06 22:20:04
要是菌很重要，就都测吧

请问测出结果怎么办 也是上blast上比对吗？还是怎样

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5楼2019-08-07 17:59:50
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zg1415

金虫 (正式写手)
对啊，还是比对

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一直被模仿，从未被超越
6楼2019-08-07 22:36:26
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头秃的兔兔

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zg1415 at 2019-08-07 22:36:26
对啊，还是比对

对比是要小于多少可以算是新菌种

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7楼2019-08-08 08:52:38
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头秃的兔兔

新虫 (初入文坛)
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6楼: Originally posted by zg1415 at 2019-08-07 22:36:26
对啊，还是比对

被屏蔽了

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8楼2019-08-09 18:39:07
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香油豆腐脑儿

新虫 (初入文坛)
你可以找四到五个保守基因或者序列进行pcr再测序比对

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9楼2019-08-20 16:03:15
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香油豆腐脑儿

新虫 (初入文坛)
除了18S还有细胞色素氧化酶一，二

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10楼2019-08-20 16:04:36
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