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【求助】并行计算节点设置
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| 我们所里面的cluster前几天电池组坏了，重修过之后，发现只能利用第一个节点计算MS了，而其他节点无法用，问过说是，重新的又加了几个节点，可能把原来的设置给搞乱了，让重新设置节点，刚接手使用，不知道怎么设置，哪位帮助解决一下啊？谢谢啊！ |
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fuzp
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这主要还是linux并行设置的问题，你可以看看 "Material Studio4.2 for linux的安装" http://qingyan1971.spaces.live.c ... 75FC440F6!353.entry 论坛里也有差不多的资料。 有不明白的再讨论 |
2楼2009-05-29 14:59:33
3楼2009-05-30 10:25:38
4楼2009-05-31 09:35:40
fuzp
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因为不清楚你的cluster的情况，所以很难判断问题出在哪。 比如，你的MS有没有重装？安装ms的账号能不能不用密码就登陆其它所有节点？是不是肯定hosts，hosts.equiv，machines.LINUX，nfs等的设置没问题。有任务分配系统么？ gw-info.sbd gwparams.cfg里的cpu总数确定是cluster的cpu之和么？ 这两个文件里 /opt/hpmpi/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/rsh -cpu_bind=v -prot -f APPFILE 这行是否对 客户端的gateway在设置更改后有没有刷新？最简单的是删掉gateway再重新加一个，我感觉ms的gateway刷新有问题。 你也可以提交一个远程任务，然后看服务器端产生的文件列表，按时间排列，然后看看最后产生的一些文件的内容。 |
5楼2009-05-31 12:03:24
6楼2009-06-01 17:19:24
请教
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我的MS里面的gw-info.sbd 文件是下面这样子的： hostname=node1 port=18888 ipaddress=19.16.0.1 pollingfrequency=5000 osname=linux osversion=2.6.9-1.667smp gatewayname=node1_18888 revision=2004.08.24 versionmajor=3 versionminor=1 cpu= Intel(R) Xeon(TM) CPU 3.00GHz 3000 MHz cputotal=20 installedmemory=2007 Mb mpiavailable=yes mpicommand=/home/bsong/MaterialsStudio/MPICH/bin/mpirun -np mpiversion=mpich-1.2.4 jobpriority=low queuingsystem=[none] 怎么没有你说的那一行啊？不懂啊 |
7楼2009-06-02 15:34:25
fuzp
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8楼2009-06-02 23:57:37
9楼2009-06-03 09:59:18
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呵呵，除了我这样喜欢自己折腾的，大部分老板对这些具体问题是不懂的，你就不要为难他了。我的意思是你联系不上以前毕业的师兄么？因为如果能联系到他们，他们就可以远程登录上来进行配置。这样比你自己摸索要快的多。当然自己摸索一下，以后出了问题就不用求人了。 另外你给出的这行不全吧 mpicommand=/home/bsong/MaterialsStudio/MPICH/bin/mpirun -np 既然以前所有节点都可以并行，而MS又没有重装，那这个设置是没问题的，我觉得你需要看看mpirun怎么设置并行，以及新增加的节点怎么加入集群。 不用客气，其实我也在想试试用mpich来并行MS，因为torque+hpmpi+MS在集群运算的时候有问题，所以我想试试用mpich来代替hpmpi看看。 [ Last edited by fuzp on 2009-6-3 at 19:23 ] |
10楼2009-06-03 19:15:58