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xiaofan66

[交流] 大家测序用pcr产物还是菌液

大家测序用pcr产物还是菌液,两者测序的结果有什么区别么?
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smallcat227

木虫 (著名写手)

★
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两者都可以,pcr产物测序技术确实是近年才发展起来的,相比起菌液方便很多,你甚至可以不纯化产物直接送测,让公司帮你纯化就行,但是成功率相对较低,而且序列两头的大概20-40个碱基可能测不出或者不准确,一般大于400bp的片段可以pcr测序,而且如果公司用引物p不出条带的话还不收钱。
菌液测序是比较经典的方法,不过现对繁琐一点,转化涂板后还要提质粒,可能还要酶切或pcr进一步确定片段插入,但目的片段插入的话成功率很高,而且准确,如果目的片段小于300bp,最好做TA克隆。
送测的菌液不用加甘油,吸过夜培养的菌液1-2ml装离心管测序就OK
30楼2009-06-01 10:10:24
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longxiange520

金虫 (小有名气)

★ ★
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sutao1979(金币+1,VIP+0):thanks 5-29 14:45
基本上我每次都是用菌液测序的,让公司自己提前质粒。pCR产物肯定也可以啊!
2楼2009-05-29 11:12:11
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
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amisking(金币+1,VIP+0):欢迎发帖交流,给个红包鼓励一下! 5-29 12:11
两者都可以,但是克隆之后测序肯定是更好的
因为PCR产物有可能是一些“嵌合体”,意思就是PCR过程中可能产生突变,这样直接测产物就会有杂峰
3楼2009-05-29 11:44:13
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)

PCR产物测序前面几十个碱基测不出来,而且也找不到引物
漫洒英雄泪,相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行?一任俺芒鞋破钵随缘化!
4楼2009-05-29 12:43:23
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